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云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求: 样品类型: 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。RNA甲基化相关酶在特殊发育时期发挥重要作用。环状DNA甲基化测序

环状DNA甲基化测序,甲基化

云序特色 √ j较全产品线:可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化; √ 特异性高:特异性富集和检测O8G氧化的 RNA的片段; √ 全转录组覆盖:全转录组范围的RNA O8G氧化检测; √ 全物种检测:可以检测几乎任何动植物的O8G氧化; √ 专业化的生信分析:强大的生信团队,专业的O8G氧化数据分析; 产品分类 O8G 全转录组测序:同时检测O8G氧化的环状RNA,LncRNA和mRNA; O8G 环状RNA测序:检测O8G氧化的所有环状RNA; O8G LnRNA测序:同时检测O8G氧化的LncRNA和mRNA; O8G mRNA测序:检测O8G氧化的所有mRNA;广西甲基化芯片云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。

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植物m6A表观转录组修饰的生物学功能尚不完全清楚。CPSF30-L是聚腺苷酸化因子CPSF30的主要亚型,由CPSF30-S和一个m6A结合的YTH结构域组成。CPSF30-L的生物学作用及其在选择性聚腺苷酸化中结合m6A功能的分子机制尚不清楚。在这里,作者揭示了CPSF30-L是拟南芥m6A的“reader”,其m6A结合功能是花卉的转型和脱落酸(ABA)响应所必需的。此外,CPSF30-L的m6A结合活性增强了液体样核体的形成,其中CPSF30-L主要识别m6A修饰的远上游元件,调控聚腺苷酸化位点的选择。

案例2:METTL1通过m7G甲基化促进let-7MicroRNA的加工原文:METTL1Promoteslet-7MicroRNAProcessingviam7GMethylation期刊:MolecularCell影响因子:14.25剑桥大学戈登研究所和病理学系中心,借助m7GRNA甲基化测序技术,识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构,进一步调控pre-let7和let7的表达,影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域。

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案例:mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化促进其翻译效率原文:AcetylationofCytidineinmRNAPromotesTranslationEfficiency期刊:Cell影响因子:36.22美国ai症研究所(NCI)和弗雷德里克实验室,发现下调NAT10(RNA乙酰化酶)能够抑制Hela细胞的行为;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修饰,下调NAT10后,ac4C的总体水平下降;为了进一步探究ac4C的功能,作者对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA测序,发现ac4C的peak主要富集在mRNA的CDS区,同时下调NAT10能够降低ac4C在mRNA中的定点表达,并与靶mRNA的下调有很大关系;作者又进一步发现ac4C乙酰化修饰能够通过延长mRNA的半衰期并促进mRNA的稳定性,同时也能够通过ac4Cpeak中的密码子偏好性表达,决定并影响mRNA的解码效率,促进底物翻译。这些发现不仅扩大了mRNA修饰范围(包括乙酰化残基),也确立了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。湖南甲基化基因

m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录。环状DNA甲基化测序

原文:METTL4catalyzesm6AmmethylationinU2snRNAtoregulatepre-mRNAsplicing期刊:NecleicAcidsResearch影响因子:16.48新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组RNA甲基化测序,在Mettl4敲除组与野生型对照组之间寻找出m6Am相对甲基化水平的差异位点,其中U2snRNA的第30位RNA残基有明显的m6Am修饰水平差异。进一步的FLAG-tag融合蛋白实验证明,METTL4蛋白直接催化了U2snRNA上的m6Am甲基化修饰的发生。METTL4过表达实验发现,其催化的RNA内部m6Am修饰位点具有HMAGKD的序列motif特征(H=A/C/U,M=A/C,K=G/U,D=A/G/U)。在Mettl4敲除的人类细胞中,因为U2snRNA无法完成m6Am修饰,故而对snRNA的pre-mRNA剪接功能产生了诸多影响。环状DNA甲基化测序

上海云序生物科技有限公司是我国RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体专业化较早的私营有限责任公司之一,公司始建于2015-03-02,在全国各个地区建立了良好的商贸渠道和技术协作关系。云序生物致力于构建商务服务自主创新的竞争力,多年来,已经为我国商务服务行业生产、经济等的发展做出了重要贡献。

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