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云序优势一站式服务客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA,云序生物为您完成从ac4CRNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。抗体富集效率高acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。分子全覆盖可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。严格的质控云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控,全程监控实验质量,保证客户得到数据。专业的生物信息学分析云序生物拥有专业的生物信息分析团队,帮助客户进行实验数据的挖掘。RNA乙酰化测序与转录组联合应用可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析,揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响,深入挖掘RNA乙酰化的功能。m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰。dam甲基化组测序

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云序生物提供两种m7GRNA甲基化测序服务:(1)m7GRNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7GRNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的整体检测。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。黑龙江甲基化利器m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。

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案例3:m6ARNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞期刊:CancerCell影响因子:27.43近年来,m6ARNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一,不断有高影响分子文章问世。m6ARNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,此时人们更关心m6ARNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期CancerCell报道了m6ARNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中,去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调,而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5,meRIP鉴定m6ARNA甲基化修饰模式,基因芯片检测差异表达>2倍的基因,终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因,其在GSCs的自我修复和tumsour形成中起到关键作用。

在本研究中,作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析,以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中,局限于一个共识基序内,主要富集于3’UTR区,且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是,m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外,在m6A修饰中观察到大量的种内变异,这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之,这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源,并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。而随后Cell Research也发表文章,证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰。

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云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求: 样品类型: 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。除了拟南芥,在其他植物中如番茄、小麦、玉米以及高粱等均发现了RNA m6A甲基化修饰。北京甲基化检测

m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。dam甲基化组测序

原文:METTL4catalyzesm6AmmethylationinU2snRNAtoregulatepre-mRNAsplicing期刊:NecleicAcidsResearch影响因子:16.48新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组RNA甲基化测序,在Mettl4敲除组与野生型对照组之间寻找出m6Am相对甲基化水平的差异位点,其中U2snRNA的第30位RNA残基有明显的m6Am修饰水平差异。进一步的FLAG-tag融合蛋白实验证明,METTL4蛋白直接催化了U2snRNA上的m6Am甲基化修饰的发生。METTL4过表达实验发现,其催化的RNA内部m6Am修饰位点具有HMAGKD的序列motif特征(H=A/C/U,M=A/C,K=G/U,D=A/G/U)。在Mettl4敲除的人类细胞中,因为U2snRNA无法完成m6Am修饰,故而对snRNA的pre-mRNA剪接功能产生了诸多影响。dam甲基化组测序

上海云序生物科技有限公司是以提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体为主的私营有限责任公司,公司成立于2015-03-02,旗下高通量测序,测序合成,科研,技术服务,已经具有一定的业内水平。公司承担并建设完成商务服务多项重点项目,取得了明显的社会和经济效益。多年来,已经为我国商务服务行业生产、经济等的发展做出了重要贡献。

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