MeRIP-Seq数据集的分析揭示了m6A与miRNA结合位点之间的存在着很强的相关性。含有m6A峰的67%的3UTR也含有至少一个TargetScan预测的miRNA结合位点。因为大约30%的基因在其3UTR中具有miRNA结合位点,所以这是显着增强的关联。重要的是,m6A峰和microRNA位点不重叠。通常,m6A峰在终止密码子附近是较丰富的,并且通常沿3UTR长度频率降低,而microRNA靶位点在3UTR的5和3末端富集.m6A在3UTR和miRNA结合位点的存在提示了mRNA甲基化和microRNA之间的相互作用。确定腺苷甲基化是否有助于microRNA诱导的mRNA沉默的作用将是重要的。发表10分以上文章较多的m6A RNA甲基化测序服务平台。顺义区m6A介绍
在研究了 FTO 对肺腺ai的作用机制的基础上,作者还进一步探索了 m6A 识别蛋白 YTHDF1 在肺腺ai中扮演的角色。首先,通过 RIP 实验,作者证明了 YTHDF1 与 MYC mRNA 的结合。随后,通过结合 FTO 敲降和 YTHDF1 敲降实验的结果,证明 FTO 表达下调所导致的 MYC mRNA 高水平 m6A 修饰,可被 YTHDF1 识别并结合,从而促进 MYC mRNA 翻译为 c-Myc 蛋白。 在本研究当中,肺腺ai致病机理当中的 “Eraser” 和 “Reader” 都得到了阐释。这些新发现对于肺腺ai的zhi疗提供了一种全新的潜在思路。石景山区平台m6AFTO 表达下调可提高 MYC mRNA 的 m6A 修饰水平。
对m6A读码器及其功能的了解正在迅速加深。越来越多的研究表明,新的m6A结合蛋白在不同的细胞类型和模型系统中具有新的作用。m6A结合蛋白通常含有YTH(YT521-B同源性)结构域。RNA下拉显示,含有YTH结构域的蛋白质通常是m6A结合剂8。这些含有YTH结构域的不同蛋白质已经表现出了与其m6A结合能力相关的广fan作用范围。与YTHDF2结合的m6A被认为在mRNA稳定性方面发挥作用9。众所周知,YTHDF1可以提高翻译的效率10。YTHDC1在m6A介导的选择性剪接中具有重要意义11。并非所有m6A结合蛋白都含有YTH结构域。eIF3在翻译上游发挥作用,并且已经证实该蛋白质在5UTR内会优先结合mRNA中的m6A,增强翻译作用12。下载我们的m6A通路海报,了解m6A读码器及其功能的更多相关信息。
m6A修饰几乎涉及RNA代谢的所有方面,含m6A基因的转录组分析也揭示了相关的功能途径与RNA代谢有关。基于甲基转移酶和去甲基酶的定位,m6A可以在核或细胞质中被引入或去除。m6A可能对RNA具有不同的作用,这取决于它在细胞核还是细胞质中被检测到。 目前,已确认m6A具有的几个功能。m6A作为mRNA的普遍的修饰,在含有METTL3的甲基转移酶时mRNA前体转录后立即发生m6A甲基化;而FTO和ALKBH5负责m6A去甲基化。 通过甲基转移酶和去甲基化酶之间的相互作用,m6A水平保持平衡,形成m6A结合蛋白的对接位点和RNA二级结构的适当组装。具有足够的m6A水平的mRNA转录物可被适当剪接,转运,翻译或降解。而不平衡的m6A调节将在上述每一步引起RNA代谢的缺陷。N6-甲基腺苷(m6A)是哺乳动物mRNA中普遍存在的表观遗传学标记。
当出现热休克时,METTL3就会定位到染色质的热休克相关的基因上,m6A就会被添加到热休克转录本上,从而诱导这些转录本在应激压力下被清chu。UV诱导DNA破坏时,METTL3/14就会在2分钟内定位到UV诱导的损伤位点,同时伴随着m6A活动的增强。在人类多能干细胞的TGF-信号转录通路转导方面,活化的SMAD2/3会与METTL3/14-WTAP相互作用,诱导m6A添加到特定的转录本上。在AML细胞中,一部分METTL3会通过METTL14非依赖方式与CCAAT增强子结合蛋白zeta(CEBPZ)的启动子区域结合。在he心pG2细胞中,H3K36me3能通过与METTL14相互作用招募写入器,诱导mRNA的CDS和3'UTR上添加m6A。m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译。西城区m6A
近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A。顺义区m6A介绍
近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰,m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。Nature正刊发表文章,证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。而随后Cell Research也发表文章,证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。顺义区m6A介绍
上海云序生物科技有限公司正式组建于2015-03-02,将通过提供以RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等服务于于一体的组合服务。旗下高通量测序,测序合成,科研,技术服务在商务服务行业拥有一定的地位,品牌价值持续增长,有望成为行业中的佼佼者。同时,企业针对用户,在RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等几大领域,提供更多、更丰富的商务服务产品,进一步为全国更多单位和企业提供更具针对性的商务服务服务。值得一提的是,云序生物致力于为用户带去更为定向、专业的商务服务一体化解决方案,在有效降低用户成本的同时,更能凭借科学的技术让用户极大限度地挖掘高通量测序,测序合成,科研,技术服务的应用潜能。