以上结果表明,AFADESI-MSI方法可以直接检测极性代谢产物,并具有高特异性,能呈现其在大脑微区分布的图像。3.在大鼠脑中绘制微区代谢网络图要了解大脑的结构区域发生的复杂代谢过程,不仅应准确表征代谢物,还要研究其相关性。从大鼠脑微区中提取代谢谱进行代谢网络重建。从15个微区提取的MSI数据进行峰挑选和峰对齐(图1F),包括松果体、中脑导水管、脑桥、梨状皮质、延髓、丘脑、纹状体、海马、胼胝体、嗅球、大脑皮层、小脑皮层、穹窿、小脑延髓和丘脑。空间代谢组学基本研究流程。四川空间代谢组学价格质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。空间代谢组技术原理 。广东空间代谢组学 代谢流空间代谢组学:该技术解决了生物组织中低含量代谢物...
展示了空间代谢组成像技术的应用。这一分析***表明脱髓鞘后新形成的髓鞘具有与正常髓鞘不同的脂质成分。因此,这种HSL方法学可能**提高目前对多发性硬化症再髓鞘形成的理解,并可能为多发性硬化症研究中评估再髓鞘形成***提供一种新的策略。此外,HSL方法可以针对***的组织量身定做,为生物医学科学中的脂质结构和成分提供至关重要的见解。该研究开发了一种基于拉曼光谱、解吸电喷雾电离质谱(空间代谢组学)和免疫荧光成像的相关脂质组成像(HSL)方法,研究多发性硬化症病变中的再髓鞘形成与正常髓鞘不同的脂质成分。结果通过对脂质结构和成分的研究为再髓鞘化***提供可能性。欧易生物空间代谢组学,服务好,科学领域,...
本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章,探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物标志物的差异研究?该研究发现了前列腺*样本中的特定组织区室的不同代谢特征,确定了几种可能被进一步开发为前列腺*的诊断和预后生物标志物的差异代谢物和脂质。空间代谢组学能够快速提供代谢物的水平差异和空间信息,是临床上有潜力的创新诊断工具。免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。空间代谢组性价比高.拥有专业技术团队。湖南空间代谢组学公司本篇为2021年8月,...
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学空间代谢...
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。谁还在盘点空间代谢组学专题?4篇,总IF:8...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小鼠发表期刊:NatureCommunications影响因子:14.919发表单位:中国医学科学院药物研究所运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等心血管和代谢疾病(CMD)是引起全世界人口过早死的主要原因。CMD有较高的发病率和死亡率,且医疗成本越来越高。小檗碱(BBR)是一种具有多种抗代谢紊乱功效的降脂植物化合物,存在于各种植物的根、茎、果实和树皮中,如黄连、水螅和小檗。在许多国家,它已经...
空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b)脂质,蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层(c)髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm),显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰(e)K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征(f)与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱(g)根据m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多,据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关;致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜,但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**...
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~《空间代谢组科...
本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷脂富含长链、多不饱和的PGs。并且,遗传学研究表明,这一机制与脂肪酸从头合成有关。这些结果表明,空间代谢组学可以区分恶性食管中的组织类型。在临床应用包括客观诊断和术中切缘评估具有潜在价值。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析。 空间代谢组性价比高.拥有专业技术团队。云南植物冷冻切片与空间代谢组学鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2、定性...
空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型,本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析;(样本策略)选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析,并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来,采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现,调查该技术在小样本上的表现,并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。空间代谢组分析测序服务。广东空间代谢组学和心脏空间代谢组学:利用基...
空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项鹿明生物空间代谢组学。云南空间代谢组学药代动力学作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组...
鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型:不喷涂基质,小分子物质检测不被基质抑制,定性物质约70%为700Da以下的小分子物质,30%为脂质大分子。空间多组学联合:空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统(连接Thermo QE高分辨质谱仪)第二套AFADESI成像系统系统(连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪)欧易生物空间代谢...
空间代谢组学:质谱成像方法提供了一种直接获取代谢网络信息的途径,以系统地深入了解大脑的代谢活动。基于KEGG数据库的Metaboanalyst软件进行代谢网络分析。共找到20条KEGG代谢通路,包含126个具有微区信息的代谢物,图2显示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代谢、花生四烯酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肌酸途径、GABA能突触、葡萄糖代谢、谷胱甘肽代谢、甘油磷脂代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸的代谢、组氨酸代谢、赖氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、多胺代谢途径、嘌呤代谢、嘧啶代谢和TCA循环、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸代谢和类固醇***合成途径。什么是空间代谢组学?。内蒙古空间代谢...
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...
空间代谢组学:食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具来提高早期诊断和精确***。脂质代谢紊乱与**的发***展密切相关,大多数脂质以甘油磷脂(GPLs)的形式储存在双分子膜中,基于甘油磷脂具有较稳定的物理化学性质,因此将其作为疾病诊断的生物标志物具有重要意义。质谱成像(MSI)可在几分钟内对冷冻切片组织的**磷脂体量化并进行客观诊断。然而,MSI是否能客观识别原发性食管腺*目前尚不清楚,这是一个重大的挑战,因为该微环境复杂,组织类型的表型相似。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。云南空间代谢组学商业应用通过空间代谢组学测量了四种转基...
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。黑龙江空间代谢组学 代谢流研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。谁还在盘点空间代谢组学专题?4篇,总I...
AFADESI-MSI空间代谢组学:1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。高准性的定性算法通过物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性进行初步代谢物注释,并可基于专属物种组织类型数据库或非靶质谱数据基础上在初步注释结果基础上进一步获得更加准确定性的结果。已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间代谢组学基本研究流程。贵州空间代谢组学的样本量在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏...
空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b)脂质,蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层(c)髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm),显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰(e)K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征(f)与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱(g)根据m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。重庆空间代谢组学质谱获取空...
AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法,能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来,从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术,灵敏度可达到 pg 级,且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级,实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别,可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构...
空间代谢组学(AFADESI-MSI):中文标题:使用敞开式质谱成像技术及代谢组学绘制大鼠脑代谢网络图研究对象:大鼠脑发表期刊:AnalyticalChemistry影响因子:6.986发表时间:2021年4月23日研究单位:中国医学科学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室运用生物技术:空间代谢组学(AFADESI-MSI)。大脑是结构**复杂的***之一,主要功能与其微区的分子相互作用密切相关。大脑的小分子调节机制对理解***功能、精神疾病机理和药物研发有很大的帮助。动物的认知过程和行为控制均依赖于脑部强大的***网络——神经连接体。科学家进行了很多研究,但是对脑部小分子网络的研...
作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。福建空间代谢组学与空间组学队列1:收集手术切除的食管腺*(EA)组织和与之匹配的健康食管上皮组织(MHEE...
基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。相关研究成果发表在Gut、PNAS、APSB、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上。目前鹿明生物已建立了特定组织专属的空间代谢组数据库鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~空间代谢组相关技术服务,经验丰富。黑龙江空间代谢组学 药效物质空间代谢...
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性。辽宁空间代谢组学与空间转录组鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...