队列1：收集手术切除的食管腺*（EA）组织和与之匹配的健康食管上皮组织（MHEE）。队列2：收集健康食管上皮组织（来自健康志愿者，HEE）和未经***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活检样本，用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化，以及队列1的外部验证。样本制备：样本制成冰冻组织切片，并结合H&E染色。研究方法：空间代谢组学；qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达；细胞转染沉默ACYL基因；免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。天津空间代谢组学是三维还是二维空间代谢组学探究MYC...

在空间上的代谢变化表明，在东莨菪碱***后，大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素，基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索，但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法，通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略，在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物，并绘制相关代谢网络，提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子（例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物）含量分布可视化。空间代谢组特异性强等优点。安徽空间代谢...

本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章，探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物标志物的差异研究？该研究发现了前列腺*样本中的特定组织区室的不同代谢特征，确定了几种可能被进一步开发为前列腺*的诊断和预后生物标志物的差异代谢物和脂质。空间代谢组学能够快速提供代谢物的水平差异和空间信息，是临床上有潜力的创新诊断工具。免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术，能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。山西空间代谢组学优势在获得AFAD...

空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型，本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析；（样本策略）选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析，并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来，采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现，调查该技术在小样本上的表现，并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。陕...

1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示，将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描，并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图，在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像，在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明，AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm，代谢物质量比较大差异为0.001Da，同一物质的检测动态范围高达...

收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本，进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE（包括正常腺体和增生）和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质，发现NCE（非*上皮细胞）、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+，其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。上海空间代谢组学图片通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-...

展示了空间代谢组成像技术的应用。这一分析***表明脱髓鞘后新形成的髓鞘具有与正常髓鞘不同的脂质成分。因此，这种HSL方法学可能**提高目前对多发性硬化症再髓鞘形成的理解，并可能为多发性硬化症研究中评估再髓鞘形成***提供一种新的策略。此外，HSL方法可以针对***的组织量身定做，为生物医学科学中的脂质结构和成分提供至关重要的见解。该研究开发了一种基于拉曼光谱、解吸电喷雾电离质谱（空间代谢组学）和免疫荧光成像的相关脂质组成像（HSL）方法，研究多发性硬化症病变中的再髓鞘形成与正常髓鞘不同的脂质成分。结果通过对脂质结构和成分的研究为再髓鞘化***提供可能性。空间代谢组三个维度的分析。云南空间代谢组...

空间代谢组学：a）小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像（b）脂质，蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层（c）髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4'，6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色（d）小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm)，显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰（e）K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征（f）与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱（g）根据m/z848.63和m/z844.52，主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质...

收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本，进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE（包括正常腺体和增生）和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质，发现NCE（非*上皮细胞）、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+，其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。空间分辨代谢组学进展和挑战。广东3d空间代谢组学空间代谢组学：前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组...

鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量：1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型：不喷涂基质，小分子物质检测不被基质抑制，定性物质约70%为700Da以下的小分子物质，30%为脂质大分子。空间多组学联合：空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组（欧易生物）两个平台，已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统，分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统（连接Thermo QE高分辨质谱仪）第二套AFADESI成像系统系统（连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪）空间代谢组学的力...

展示了空间代谢组成像技术的应用。这一分析***表明脱髓鞘后新形成的髓鞘具有与正常髓鞘不同的脂质成分。因此，这种HSL方法学可能**提高目前对多发性硬化症再髓鞘形成的理解，并可能为多发性硬化症研究中评估再髓鞘形成***提供一种新的策略。此外，HSL方法可以针对***的组织量身定做，为生物医学科学中的脂质结构和成分提供至关重要的见解。该研究开发了一种基于拉曼光谱、解吸电喷雾电离质谱（空间代谢组学）和免疫荧光成像的相关脂质组成像（HSL）方法，研究多发性硬化症病变中的再髓鞘形成与正常髓鞘不同的脂质成分。结果通过对脂质结构和成分的研究为再髓鞘化***提供可能性。空间代谢组学的力量探究前列腺*。上海空间...

空间代谢组学：伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果，该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法，旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程，对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题：脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象：食管腺*发表期刊：CancerResearch影响因子：12.701发表单位：伦敦帝国理工学院运用生物技术：空间代谢组学空间代谢...

空间代谢组学：该技术解决了生物组织中低含量代谢物难检测、覆盖种类少和成像质量差等技术难题，可实现生物组织中约1500个代谢物的成像分析，包括胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类和脂质类等，并精确表征与识别功能代谢物在组织亚区域的分布特征。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下，经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累，鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析，积累了丰富的样本前处理经验。空间代谢组学哪家好,为各类科学领域提供线索和方向。广东空间代谢组学是...

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同...

空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图，从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D，E)。一般说来，数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性，作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子，作者回归了m/z844.52pC(38：6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰，表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明，可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系，这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构...

2021年9月30日，国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划项目指南的通告》中，也表达了对于空间多维组学的资助支持。2021年11月推出的“鹿明空间代谢组千万医学支持计划（***期）”获得了许多科研工作者的关注及参与。现正式推出“鹿明空间代谢组千万医学支持计划（第二期）”。本次“鹿明空间代谢组千万医学支持计划（第二期）”采用的AFADESI空间代谢组平台，是基于中国医学科学院药物研究所再帕尔•阿不力孜教授与贺玖明教授团队经过十年精心打磨，自主研发成功的AFAI-MSI仪器平台。空间代谢组性价比高.拥有专业技术团队。安徽空间代谢组学英文空间代谢组学能够...

AFADESI空间代谢组技术：免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术，能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下，经过2021年一整年的研发及项目运营落地，鹿明生物积赞了如下优势。一、**支持AFADESI-MSI原创团队****-贺玖明教授（中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI）全力支持，参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analytic...

空间代谢组学：伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果，该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法，旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程，对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题：脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象：食管腺*发表期刊：CancerResearch影响因子：12.701发表单位：伦敦帝国理工学院运用生物技术：空间代谢组学空间代谢...

结果表明，原*基因MYC与SERBP蛋白共同调节**生长所必需的脂肪生成，MYC诱导SREBP1，然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促进脂肪链的延伸。小鹿推荐通过空间代谢组学技术，能够观察到MYC诱导后不同**的体内脂质组学变化，准确地绘制MYC特异性脂质代谢的位置，因此可以利用这一**的致命弱点，用于新的抗脂质药物研究开发。在获得空间代谢组学AFADESI平台原创团队全力支持下，截止2021年9月，鹿明生物已经完成共计近千例样本经验，包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析，检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类...

空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型，本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析；（样本策略）选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析，并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来，采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现，调查该技术在小样本上的表现，并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。空间代谢组分析测序服务。河南空间代谢组学英文空间代谢组学主要从事质...

AFADESI-MSI空间代谢组学：中文标题：一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象：大鼠肾脏，大鼠脑和人食道*组织发表期刊：AdvancedScience影响因子：16.806运用生物技术：AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文，通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像（AFADESI-MSI）技术，绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱，将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...

收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本，进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE（包括正常腺体和增生）和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质，发现NCE（非*上皮细胞）、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+，其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。空间代谢组加速您的科研项目进程.欢迎免费咨询!。贵州空间代谢组学 书籍 本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷...

队列1：收集手术切除的食管腺*（EA）组织和与之匹配的健康食管上皮组织（MHEE）。队列2：收集健康食管上皮组织（来自健康志愿者，HEE）和未经***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活检样本，用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化，以及队列1的外部验证。样本制备：样本制成冰冻组织切片，并结合H&E染色。研究方法：空间代谢组学；qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达；细胞转染沉默ACYL基因；免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。空间分辨代谢组学进展和挑战。天津空间代谢组学 中药活性成分结果表明，原*基因MYC与SERBP蛋白...

空间代谢组学：中文标题：MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象：小鼠发表期刊：CellMetabolism影响因子：27.287合作单位：斯坦福大学运用生物技术：空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因，在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用，其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多，据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关；致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜，但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**...

通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m/z：700–1000），发现两组存在***差异，尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短（18个碳或更少）的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势，然后开始减少，但酰基侧链较长的PG含量持续增加（图 5）。MYC失活后，这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明，MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA（图6C）。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度（图6D）。结果显示，MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。什么是空间代谢组学？。辽宁尿液空间代谢组学...

空间代谢组学：中文标题：MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象：小鼠发表期刊：CellMetabolism影响因子：27.287合作单位：斯坦福大学运用生物技术：空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因，在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用，其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。本篇由斯坦福大学DeanW.Felsher课题组在CellMetabolism发表的研究成果，通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制，发现MYC与胆固醇调节元件...

空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果，通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制，发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白（SREBP1）协同调节脂质生成，从而促进疾病...

获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱（图5D，G）以及平均差谱，以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异（图5E，H）。制作的图像显示了属于注射侧（红色）或非注射侧（绿色）的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征，与对侧正常侧（非注射侧）相比，再髓鞘损伤（注射侧）发生了高度特异性的分子变化，尤其是正离子模式（图5F，I）。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰，并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明，再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布，这是脱髓...

空间代谢组学：中文标题：粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象：人粪便、血清、组织发表期刊：Gut影响因子：23.059发表时间：2021年8月发表单位：国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术：AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*（CRC）的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害，大规模使用仍受限制。因此，发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间代谢组学:一种高灵敏、高覆...

AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...