分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
AFADESI-MSI空间代谢组学:1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。高准性的定性算法通过物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性进行初步代谢物注释,并可基于专属物种组织类型数据库或非靶质谱数据基础上在初步注释结果基础上进一步获得更加准确定性的结果。已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间代谢组具有覆盖范围广,灵敏度高,动态范围宽。天津空间代谢组学优势质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。曾经错过热潮—空间转录组,别再错过新秀...
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。福建深度空间代谢组学是靶向代谢组吗获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱(图5D,G)以及平均差谱...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性。湖北软骨空间代谢组学队列1:收集手术切除的食管腺*(EA)组织和与之匹配的健康食管上皮组织(MHEE)。队列2:收集...
1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示,将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描,并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图,在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像,在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明,AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm,代谢物质量比较大差异为0.001Da,同一物质的检测动态范围高达...
作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA,发现MYC**中不饱和脂肪酸(FA(18:1))的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢,而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时,细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。空间代谢组技术特点。天津药物空间代谢组学空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小鼠发表期刊:NatureCommunications影响因子:14.919发表单位:中国医学科学院药物研究所运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等心血管和代谢疾病(CMD)是引起全世界人口过早死的主要原因。CMD有较高的发病率和死亡率,且医疗成本越来越高。小檗碱(BBR)是一种具有多种抗代谢紊乱功效的降脂植物化合物,存在于各种植物的根、茎、果实和树皮中,如黄连、水螅和小檗。在许多国家,它已经...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。鹿明生物购入空间代谢组学,并构建深度空间代谢组学的完整解决方案。吉林质谱成像空间代谢组学空间...
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研,。青海空间代谢组学研究意义空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药...
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构...
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。北京玉米空间代谢组学空间代谢组学(AFADESI-MSI):中文标题:使用敞开...
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。空间代谢组学 技术咨询中心。海南空间代谢组学与空间组学空间代谢组学:食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具来提高...
空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项空间代谢组学的力量探究前列腺*。上海药物空间代谢组学质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能...
进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正常白质组织,旨在获得与患者再髓鞘病变相关的特定脂质谱(图6D−1)。通过串联质谱法确认鉴定的脂质,并在表2中报告。正如在小鼠组织分析中所观察到的,再髓鞘化区域主要在PC和PE脂质群的组成上不同。结果表明,HSL成像可以有效地用于多发性硬化患者死后病变的脂质谱分析,并表明多发性硬化患者再髓鞘化过程中产生的髓鞘与附近正常出现的白质相比具有改变的脂质谱。(a)正常白质(NAWM)和有髓鞘病变的平均拉曼光谱±1标准差(SD)。(b)平均差谱±1SD(NAWM−再髓鞘损伤)在结构水平显示再髓鞘过程。(c)基于有髓损伤的拉曼光谱的P***A后验概率图像突出NAW...
空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高,在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高,与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物(柠檬酸盐,天冬氨酸盐,锌和精胺)水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调,导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。广西植物冷冻切片与空间代谢组学本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离...
空间代谢组学:质谱成像技术近二十年来,随着质谱离子化技术的不断发展,质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息,越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中,为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础,下面进入到质谱“画”时代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“灵魂”3问,首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比,获得定性和定量的信息,进而去探究物质本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”这两个根本性问题。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。浙江空间代谢组学概...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。空间代谢组支持个性化定制。陕西尿液空间代谢组学空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小鼠发表期刊:NatureCommunications影响因子:14.919发表单位:中国医学科学院药物研究所运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等心血管和代谢疾病(CMD)是引起全世界人口过早死的主要原因。CMD有较高的发病率和死亡率,且医疗成本越来越高。小檗碱(BBR)是一种具有多种抗代谢紊乱功效的降脂植物化合物,存在于各种植物的根、茎、果实和树皮中,如黄连、水螅和小檗。在许多国家,它已经...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。广西植物冷冻切片与空间代谢组学空间代谢组学主要从事质谱...
空间代谢组学:质谱成像技术近二十年来,随着质谱离子化技术的不断发展,质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息,越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中,为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础,下面进入到质谱“画”时代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“灵魂”3问,首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比,获得定性和定量的信息,进而去探究物质本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”这两个根本性问题。空间代谢组技术原理 。浙江空间代谢组学技术怎么应用...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~空间代谢组学:...
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。湖南...
空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项什么是空间代谢组学?。四川空间代谢组学 书籍1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也...
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同...