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空间代谢组学基本参数
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  • 欧易生物
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  • 上海欧易生物科技有限公司
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  • 产品检测,科研服务,技术研究
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空间代谢组学企业商机

在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。曾经错过热潮—空间转录组,别再错过新秀—空间代谢组。湖北3d空间代谢组学

空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源,如DESI(解吸电喷雾电离源)、MALDI(基质辅助激光解吸电离源),与质谱相联,通过可视化的成像软件,使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现,进而提供化合物“在哪里?”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理,DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术,其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下,不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助,可更真实反映样品表面分子分布特征。河北空间代谢组学和普通代谢组学空间代谢组学基于AFADESI-MSI的代谢物研究。

如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。

展示了空间代谢组成像技术的应用。这一分析***表明脱髓鞘后新形成的髓鞘具有与正常髓鞘不同的脂质成分。因此,这种HSL方法学可能**提高目前对多发性硬化症再髓鞘形成的理解,并可能为多发性硬化症研究中评估再髓鞘形成***提供一种新的策略。此外,HSL方法可以针对***的组织量身定做,为生物医学科学中的脂质结构和成分提供至关重要的见解。该研究开发了一种基于拉曼光谱、解吸电喷雾电离质谱(空间代谢组学)和免疫荧光成像的相关脂质组成像(HSL)方法,研究多发性硬化症病变中的再髓鞘形成与正常髓鞘不同的脂质成分。结果通过对脂质结构和成分的研究为再髓鞘化***提供可能性。空间代谢组得到了广大医学领域科研工作者的信任。

1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。鹿明生物空间代谢组学。北京空间代谢组学是三维还是二维

空间代谢组学又有什么用呢?。湖北3d空间代谢组学

AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片,将发现的代谢物***映射代谢网络,并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量,还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物,以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示,找到三种代谢物(N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸),属于色氨酸代谢途径,意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区,发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物,而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下,脑桥和大脑皮层可能是受影响**严重的区域。湖北3d空间代谢组学

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