AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片，将发现的代谢物***映射代谢网络，并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量，还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物，以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示，找到三种代谢物（N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸），属于色氨酸代谢途径，意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区，发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物，而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下，脑桥和大脑皮层可能是...

空间代谢组学：中文标题：粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象：人粪便、血清、组织发表期刊：Gut影响因子：23.059发表时间：2021年8月发表单位：国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术：AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*（CRC）的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害，大规模使用仍受限制。因此，发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间代谢组相关技术服务,经验丰...

通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-ALL）中甘油磷脂（GPs）的含量，发现在不同的**中，MYC诱导改变了磷酸酰甘油（PGs）的丰度（图 4A），能够增加了大多数PG物质。MYC失活后，PG丰度恢复到基础水平（图 4B）。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成，因此，PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而，在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成，这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的，免标记、无需基质、周期短。海南空间代谢组学在医药应用鹿明生物AFADESI-M...

获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱（图5D，G）以及平均差谱，以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异（图5E，H）。制作的图像显示了属于注射侧（红色）或非注射侧（绿色）的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征，与对侧正常侧（非注射侧）相比，再髓鞘损伤（注射侧）发生了高度特异性的分子变化，尤其是正离子模式（图5F，I）。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰，并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明，再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布，这是脱髓...

作者使用NMR对C原子进行示踪实验，发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成（图3）。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA，发现MYC**中不饱和脂肪酸（FA（18：1））的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢，而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时，细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此，MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。蛋白质组学的研究方法。浙江空间代谢组学技术怎么应用通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m...

获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱（图5D，G）以及平均差谱，以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异（图5E，H）。制作的图像显示了属于注射侧（红色）或非注射侧（绿色）的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征，与对侧正常侧（非注射侧）相比，再髓鞘损伤（注射侧）发生了高度特异性的分子变化，尤其是正离子模式（图5F，I）。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰，并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明，再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布，这是脱髓...

空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果，通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制，发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白（SREBP1）协同调节脂质生成，从而促进疾病...

空间代谢组学：比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高，在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高，与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物（柠檬酸盐，天冬氨酸盐，锌和精胺）水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调，导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。空间代谢组学所解决的科研问题。贵州空间代谢组学 代谢流空间代谢组学主要从事质谱成像新技术、空间分辨代谢组学新方法及其在生物医药应用研究和临床前新药代谢研究...

研究表明，MYC对磷脂酰肌醇（PI）代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中，MYC可逆地降低了PI；但在LC和HCC中，MYC反而增加了这些物质（图 7）。可能是由于肺表面富含PG和PI，MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断，MYC通常能够增加PGs含量，但以组织特异性方式差异调节其他GPs，如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究，通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成，从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖（图 8）。空间代谢组学一个样本多少钱。陕西空间代谢...

分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术（MSI）是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术，在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像（AFADESI-MSI）技术的代谢网络映射方法，对大鼠脑不同极性的小分子代谢物（m/z50-500Da）进行微区分布研究，不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物，还绘制了包含神经递质、嘌呤，有机酸，多胺，胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络，并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...

空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果，通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果，发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...

1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死（处理组，3只），对照组大鼠（3只）也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑，在低温下将大脑切成连续的矢状切片（暴露出海马和纹状体），用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析，代谢物质量数范围50-500Da，质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化，再使用自建MassImager软件获取成像结果；在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后，使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠（rattusnorvegicus）为参考完成代谢物高通量定性，...

如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略，用于分子表征和定量再髓鞘形成，并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱，用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间，在有髓鞘组织和正常有髓组织之间，脂质成分皆存在差异。代谢组学分析、空间转录组测序价格、代谢组学分析。上海质谱成像与空间代谢组学鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量：1000-3000个代谢物。2、定性代...

AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片，将发现的代谢物***映射代谢网络，并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量，还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物，以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示，找到三种代谢物（N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸），属于色氨酸代谢途径，意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区，发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物，而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下，脑桥和大脑皮层可能是...

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同...

研究表明，MYC对磷脂酰肌醇（PI）代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中，MYC可逆地降低了PI；但在LC和HCC中，MYC反而增加了这些物质（图 7）。可能是由于肺表面富含PG和PI，MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断，MYC通常能够增加PGs含量，但以组织特异性方式差异调节其他GPs，如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究，通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成，从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖（图 8）。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。安徽空间...

质谱成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作为一种新型的分子影像技术，能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法（如荧光成像、放射性标记成像等），该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理，具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法，可从生物组织原位发现差异代谢物，并识别其生物学功能。定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法。天津空间代谢组学 肝炎AFADES...

质谱成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作为一种新型的分子影像技术，能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法（如荧光成像、放射性标记成像等），该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理，具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法，可从生物组织原位发现差异代谢物，并识别其生物学功能。曾经错过热潮—空间转录组,别再错过新秀—空间代谢组。湖南空间代谢组学 书籍鹿明生物空间代谢组学...

空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源，如DESI（解吸电喷雾电离源）、MALDI（基质辅助激光解吸电离源），与质谱相联，通过可视化的成像软件，使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现，进而提供化合物“在哪里？”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理，DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术，其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下，不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助，可更真实反映样品表面分子分布特征。质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。福建空间代谢组学的n要多少再帕尔·阿不力孜、贺玖明研究团队运用空间代谢组学绘制大...

AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...

空间代谢组学：中文标题：粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象：人粪便、血清、组织发表期刊：Gut影响因子：23.059发表时间：2021年8月发表单位：国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术：AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*（CRC）的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害，大规模使用仍受限制。因此，发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间分辨代谢组学进展和挑战。山...

空间代谢组学研究：一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法，发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分，探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理，描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱，为评估再...

空间代谢组学：绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像，直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓，但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷，ATP=三磷酸腺苷，GPEA=甘油磷酰乙醇胺，HBCt=羟基丁酰肉碱，HE=苏木精和伊红，LPC=溶血磷脂酰胆碱，NAA=N-乙酰天冬氨酸，PE=磷脂酰乙醇胺，PI=磷脂酰肌醇谁还在盘点空间代谢组学专题?4篇,总IF:82,篇篇经典~。安徽植物冷冻切片与空间代谢组学通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型（肺*（LC）、...

空间代谢组学研究：一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法，发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分，探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理，描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱，为评估再...

结果表明，原*基因MYC与SERBP蛋白共同调节**生长所必需的脂肪生成，MYC诱导SREBP1，然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促进脂肪链的延伸。小鹿推荐通过空间代谢组学技术，能够观察到MYC诱导后不同**的体内脂质组学变化，准确地绘制MYC特异性脂质代谢的位置，因此可以利用这一**的致命弱点，用于新的抗脂质药物研究开发。在获得空间代谢组学AFADESI平台原创团队全力支持下，截止2021年9月，鹿明生物已经完成共计近千例样本经验，包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析，检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类...

1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死（处理组，3只），对照组大鼠（3只）也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑，在低温下将大脑切成连续的矢状切片（暴露出海马和纹状体），用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析，代谢物质量数范围50-500Da，质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化，再使用自建MassImager软件获取成像结果；在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后，使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠（rattusnorvegicus）为参考完成代谢物高通量定性，...

在获得AFADESI平台原创团队全力支持下，截止2021年9月，鹿明生物已经完成共计近千例样本经验，包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析，检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物。欢迎各老师咨询~空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统，分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。欧易生物、鹿明生物2021年即拥有空间代谢组和空间转录组（欧易生物）两个平台，已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间代谢组学,代谢组数据库。北京质谱成像空间代谢组学鹿明生物引...

空间代谢组学：质谱成像技术近二十年来，随着质谱离子化技术的不断发展，质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息，越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中，为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础，下面进入到质谱“画”时代~是什么？有多少？在哪里？回答以上“灵魂”3问，首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比，获得定性和定量的信息，进而去探究物质本身包含的化合物“是什么？”和“有多少？”这两个根本性问题。空间代谢组具有覆盖范围广,灵敏度高,动态范围宽。河...

空间代谢组学：前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异，例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异，表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性，质谱成像过程中存在分子离域，可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项空间分辨代谢组学进展和挑战。黑龙江质谱成像与空间代谢组学空间代谢组学主要从事质谱成像新技术、空间分辨代谢组学新方法及其在生物医药应用研究和临床前新药代谢研...

通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m/z：700–1000），发现两组存在***差异，尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短（18个碳或更少）的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势，然后开始减少，但酰基侧链较长的PG含量持续增加（图 5）。MYC失活后，这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明，MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA（图6C）。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度（图6D）。结果显示，MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组学所解决的科研问题。四川空间代谢...