空间代谢组学研究：一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法，发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分，探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理，描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱，为评估再髓鞘化***提供新策略。空间代谢组学,代谢组数据如何分析。河南玉米空间代谢组学
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m/z：700–1000），发现两组存在***差异，尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短（18个碳或更少）的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势，然后开始减少，但酰基侧链较长的PG含量持续增加（图 5）。MYC失活后，这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明，MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA（图6C）。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度（图6D）。结果显示，MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。重庆深度空间代谢组学是靶向代谢组吗空间代谢组学一个样本多少钱。
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图，从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D，E)。一般说来，数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性，作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子，作者回归了m/z844.52pC(38：6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰，表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明，可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系，这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。
AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的，免标记、无需基质、周期短。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组特异性强等优点。重庆深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
空间代谢组三个维度的分析。河南玉米空间代谢组学
空间代谢组学：伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果，该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法，旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程，对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题：脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象：食管腺*发表期刊：CancerResearch影响因子：12.701发表单位：伦敦帝国理工学院运用生物技术：空间代谢组学河南玉米空间代谢组学
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