1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。重庆深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。安徽植物冷冻切片与空间代谢组学空间代谢组学基本研究流程。
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的AFADESI-MSI方法,用于原位分析组织上的代谢物并发现特异性生物标志物。通过非靶向分析,在大鼠脑、肾脏和人食道*组织中观察到数千种代谢物,为分子组织学研究提供了有力的分析工具。
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和肝细胞摄取BBR,还能降低血浆中的脂质和促炎细胞因子。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。
AFADESI空间代谢组技术:免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,经过2021年一整年的研发及项目运营落地,鹿明生物积赞了如下优势。一、专家支持AFADESI-MSI原创团队**专家-贺玖明教授(中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI)全力支持,参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上发表10+篇。谁还在盘点空间代谢组学专题?4篇,总IF:82,篇篇经典~。重庆深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
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通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。重庆深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
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