空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b)脂质,蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层(c)髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm),显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰(e)K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征(f)与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱(g)根据m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质分离,推测为Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(h)灰质和白质的代表性的平均空间代谢质谱图(分别以绿色和红色表示) 质谱成像技术可以实现生物上千代谢物的定性。湖南花瓣空间代谢组学
再帕尔·阿不力孜、贺玖明研究团队运用空间代谢组学绘制大鼠脑代谢网络图。2021年4月,中国医学科学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室再帕尔·阿不力孜、贺玖明团队在分析化学一区《Analytical Chemistry》期刊发表封面文章,题为“Mapping metabolic networks in the brain by using ambient mass spectrometry imaging and metabolomics”的研究成果,通过空间代谢组学技术,***揭示了大鼠脑代谢网络,深入解析了东莨菪碱致大鼠记忆功能障碍模型脑的代谢变化。江苏空间代谢组学优势空间代谢组特异性强等优点。
1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示,将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描,并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图,在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像,在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明,AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm,代谢物质量比较大差异为0.001Da,同一物质的检测动态范围高达1000倍。如图1所示,通过AFADESI-MSI可在大鼠脑部检测到一些呈特征性分布有代表性的极性代谢物,其强度范围从0到104甚至到106。
AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片,将发现的代谢物***映射代谢网络,并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量,还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物,以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示,找到三种代谢物(N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸),属于色氨酸代谢途径,意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区,发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物,而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下,脑桥和大脑皮层可能是受影响**严重的区域。空间代谢组支持个性化定制。
空间代谢组学:该技术解决了生物组织中低含量代谢物难检测、覆盖种类少和成像质量差等技术难题,可实现生物组织中约1500个代谢物的成像分析,包括胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类和脂质类等,并精确表征与识别功能代谢物在组织亚区域的分布特征。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。蛋白质组学的研究方法。广西空间代谢组学基本研究流程
空间代谢组学-代谢组学服务-擅长多组学联合分析。湖南花瓣空间代谢组学
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM将会在2022年对空间代谢组学研究带来更高效的产能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已拥有2台空间代谢组学**研究设备(见下方图片)。相信鹿明生物的2022将帮助各位科研学者提供更加快速、质量的研究。请期待鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。湖南花瓣空间代谢组学
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