空间代谢组学研究：一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法，发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分，探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理，描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱，为评估再髓鞘化***提供新策略。一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。广西空间代谢组学基本研究流程
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。海南3d空间代谢组学空间代谢组通过质谱成像技术。
AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。
AFADESI-MSI空间代谢组学：1、已落地执行项目100+，其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。高准性的定性算法通过物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性进行初步代谢物注释，并可基于专属物种组织类型数据库或非靶质谱数据基础上在初步注释结果基础上进一步获得更加准确定性的结果。已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间代谢组产品齐全,价格低,高效专业。
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队列1：收集手术切除的食管腺*（EA）组织和与之匹配的健康食管上皮组织（MHEE）。队列2：收集健康食管上皮组织（来自健康志愿者，HEE）和未经***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活检样本，用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化，以及队列1的外部验证。样本制备：样本制成冰冻组织切片，并结合H&E染色。研究方法：空间代谢组学；qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达；细胞转染沉默ACYL基因；免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。广西空间代谢组学基本研究流程
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