AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的AFADESI-MSI方法,用于原位分析组织上的代谢物并发现特异性生物标志物。通过非靶向分析,在大鼠脑、肾脏和人食道*组织中观察到数千种代谢物,为分子组织学研究提供了有力的分析工具。空间代谢组相关技术服务,经验丰富。四川3d空间代谢组学
空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源,如DESI(解吸电喷雾电离源)、MALDI(基质辅助激光解吸电离源),与质谱相联,通过可视化的成像软件,使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现,进而提供化合物“在哪里?”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理,DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术,其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下,不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助,可更真实反映样品表面分子分布特征。辽宁空间代谢组学与空间转录组欧易生物空间代谢组学,服务好,科学领域,提供方向。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。空间代谢组学是广大客户的选择,认准鹿明生物。
收集了15名前列腺*患者共计45份新鲜冷冻组织**样本,进行空间代谢组学分析。从而实现对良性区域和**、NCE(包括正常腺体和增生)和**的不同组织类型的代谢组和脂质组学研究。样品和分析概述成功鉴定了 27 种代谢物和 44 种脂质,发现NCE(非*上皮细胞)、基质细胞和**组织代谢存在明显差异。欧易生物鹿明生物丰富的项目实战经验1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。广西空间代谢组学概念
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空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。四川3d空间代谢组学
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