海淀区m1A全转录组测序

本研究是由北京大学生命科学学院伊成器研究组领衔，联合化学与分子工程学院王初课题组、分子医学研究所陈晓伟课题组以及美国康奈尔大学钱书兵课题组等单位的一篇研究论文。论文报道的是一项新型RNA甲基化的测序技术，作者将其命名为m1A-MAP。通过这项技术，可在全转录组水平上单碱基分辨鉴定m1A（1-甲基腺嘌呤）修饰位点，作者还通过m1A-MAP绘制了人细胞核和线粒体转录组中不同类型的m1A甲基化组。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰m1A  ，云序生物。海淀区m1A全转录组测序

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直到2016年，来自芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文，该研究通过m1A RNA甲基化测序和RIP测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行jiao全的分析,揭示了一种小型的化学修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。这种小型的修饰具有进化保守性，而且在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在，但其位置以及对基因表达的效应却可以反应一种新形式的表观转录组学控制。这项研究发现为生物学世界提供了一种新的视野。

何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日，美国芝加哥大学BryanC.Dickinson团队与何川团队在NatureMethods上发表“EvolutionofareversetranscriptasetomapN1-methyladenosineinhumanmessengerRNA”研究成果，该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台，可快速选择逆转录酶，使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点，并使其发生突变，从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测，在测序过程中产生突变标记，终实现单碱基识别m1A，为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。试剂盒哪家好，上海云序生物，您的选择。

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用proteinA磁珠（ThermoFisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（ThermoFisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在IlluminaHiseq测序仪上进行双端150bp测序。Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。邯郸分析m1A

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2.m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNAm1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。海淀区m1A全转录组测序

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