沧州m1Apri-miRNA测序

m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化。沧州m1Apri-miRNA测序

2.m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNAm1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。津南区遗传m1A伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6ARNA甲基化的研究已进行的如火如荼，但除了m6A以外仍有多种热门RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究极具潜力，近期不断有高影响因子文章的出现（如表1）。云序生物是国内RNA修饰测序的先驱，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务(m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前，云序已累计支持客户发表25篇高水平文章，合计影响因子171.6分，是国内支持发文较多、累计影响因子较高的公司。

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用proteinA磁珠（ThermoFisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（ThermoFisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在IlluminaHiseq测序仪上进行双端150bp测序。生物在线，丁香通，生物器材，搜狐网均有云序的文章。

案例1：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文：The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊：Nature 影响因子：41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文，该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析，揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性，在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。上海云序生物，一家专业做测序，试剂盒的良心企业。通州区m1Apri-miRNA测序

分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。沧州m1Apri-miRNA测序

这一分布规律与m6A（真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰）截然不同，后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上，并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3，并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此，该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1ARNA修饰的谱图，也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，沧州m1Apri-miRNA测序

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