平谷区m1AmRNA测序

MolecularCancer（IF=10.679）杂志刊登了m6A修饰研究：m6A依赖的糖酵解增强结直肠ai（CRC）发生。该文章采用多组学联合应用技术检测了Mettl3-KO(m6A甲基化转移酶敲除细胞株)和WTHCT116（结直肠ai细胞株）甲基化修饰，这项研究揭示METTL3通过m6A-IGF2BP2/3-依赖性机制稳定HK2和SLC2A1(GLUT1)在CRC中表达，表明m6A修饰的糖酵解途径可以促进结直肠ai的发展，同时为以METTL3及其途径为靶点高糖代谢的CRC患者提供了合理的zhi疗靶点和zhi疗方向。m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰。平谷区m1AmRNA测序

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案例3：细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊：MolecularCell 影响因子：13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1ARNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明，位于5’UTR 区，尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译，而位于编码区的m1A 可抑制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰，还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。

为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异，RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织，发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化，而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现，AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大，且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目，暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用proteinA磁珠（ThermoFisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（ThermoFisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在IlluminaHiseq测序仪上进行双端150bp测序。m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。宁河区m1Apri-miRNA测序

还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。平谷区m1AmRNA测序

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