由于细胞作为机体的基本单元，在特定的空间位置与微环境协同，发挥其特有的生物学功能，所以对于研究和理解细胞生物学、**生物学、发育生物学等学科的发生机制来说，空间位置信息尤为重要。显微成像（包括超分辨率和单分子成像）、多重荧光原位杂交等技术的发展加深了我们对细胞、组织结构和功能的理解；测序技术使得我们能够对未知的细胞或组织中基因的表达情况进行定量和定性分析。空间转录组可以结合显微成像和测序技术在获得基因表达数据的同时很大程度的保留样本的空间位置信息，使得研究人员能够发现更多有价值的东西。Science发表了将组织扩展和原位RNA测序结合起来的新型空间转录组技术ExSeq。湖南发展空间转录组
美国脑计划启动的 BICCN 项目，该项目将整合不同类型细胞的分子、解剖学和生理学特性，创建小鼠脑细胞 3D 参考图谱，同时也将基于人类和非人类灵长类脑组织样本，绘制脑细胞参考图谱 ，其涉及空间转录组学技术主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些实现空间转录组学的重要技术，可以追溯到二十世纪七十年代，长期以来，各种形式的原位杂交技术（ISH）已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出，空间转录组技术重要为特殊的载玻片。应用空间转录组多少钱空间转录组使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。
空间重构的计算策略：这种计算方法可以充分利用内在基因表达模式或共表达的趋势，从单个细胞的大量转录组数据中重构细胞间的环境。然而，这些推论方法在某些情况下*呈现空间趋势或特定组织的总体布局。基于LCM的方法：基于LCM的转录组学或基因组学成功地获得了单个细胞的空间转录组，尽管其通量很低，但是在可以标记成千上万个单个细胞位置的多路复用条形码策略可行之前，将少量细胞的数据粗略地整合到构成***的巨大背景中，可能具有一定价值。基于图像的原位转录组学：基于图像的原位转录组学在很大程度上增加了可检测区域，但也存在一些问题，例如几种smFISH方法很难从包括信号干扰、转录本积累等复杂背景中提取单个细胞。空间条形码加高通量：费用较高且无法在单个细胞中获得转录组。
空间转录组主要是研究细胞或组织中基因的表达模式和调控机制。它通过将细胞或组织中的RNA分子与其所在的空间位置相对应，可以提供关于基因表达的空间信息。这种技术可以帮助研究人员了解细胞或组织中不同基因的表达水平、细胞类型的分布以及基因调控网络的组织结构。通过空间转录组，研究人员可以揭示细胞和组织的功能和发育过程中的基因表达动态，以及与疾病相关的异常基因表达模式。空间转录组是指在细胞或组织中，基因在空间上的表达模式。基因是生物体内负责遗传信息传递和表达的基本单位，而空间转录组则描述了基因在细胞或组织中的空间分布和表达水平。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。
在上一篇中我们介绍了利用10×Genomics空间转录组平台研究植物样本时，从样本包埋到玻片染色的基本实验流程。本文中，小欧针对实验流程中**为关键的步骤——切片和贴片实验中的一些操作小技巧进行了整理，希望能帮助大家更好地开展植物空间转录组学的项目研究。切片完成后并不意味着整个切片过程就结束了，如何把样本切片又快又好的贴到玻片上，尤其是正式玻片的特定有效捕获区域内，也是确保后续实验顺利进行的关键问题。对于动物样本，虽然有些疏松结缔组织或脂肪组织样本在切片时也会出现易破碎的现象，但对于大部分比较致密的结构组织样本，切片和贴片相对比较容易，对组织修片（调整组织大小）也相对简单些。但对于植物组织样本而言，则需要关注到更多操作细节。细胞通讯是单细胞研究中一个模拟与理解复杂组织生态系统动力学的适用方法。江西空间转录组报价
除了皮肤、胰腺和骨头组织外，其余样本类型均可开展10x Genomics空间转录组研究。湖南发展空间转录组
转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取，目前已有多种技术策略被开发报道，如空间转录组技术（SpatialTranscriptomics，ST）和Visium技术，通过将包含空间位置信息的条形码、UMI标签、poly-dT的探针固定在商用微阵列载玻片上，来捕获包含poly(A)尾巴的转录本，**终获取全转录组水平的基因表达及位置信息。在Slide-Seq中，探针通过微液滴将混合组合标签、UMI标签和poly-dT置于单层载玻片上，而在HDST中，探针被置于载玻片上蚀刻的孔中。在DBiT-seq中，则通过微流体通道生成空间阵列，微通道用于在一个方向上提供一种类型的标签，然后在垂直方向上提供另一种类型的标签，形成正交连接通道，以便可以通过***的成对组合标签识别每个斑点位置。 湖南发展空间转录组
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