10xVisium空间转录组技术原理为将新鲜冷冻的组织切片，置于文库制备载玻片上，经过固定、染色和透化后，释放出mRNA，mRNA与空间条形码捕获探针相结合，从而捕获基因表达信息。然后将捕获的mRNA合成cDNA并制备测序文库进行测序，并对数据进行可视化分析。空间转录组技术作为当今**前沿的科研技术，相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中，快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。研究通过对 ALS 小鼠疾病进程（症状前、发病、症状期和终末期）的脊髓组织进行空间转录组测序。江苏空间转录组有什么用
单细胞空间转录组数据分析可视化平台 目前， 8种空间转录组技术，这些数据来自5个物种，包括人类、小鼠、果蝇、秀丽隐杆虫线和斑马鱼。研究团队针对这些数据集进行了整合中统计描述的转录组技术研究团队从论文中提取了每种技术的简要说明和示意图，并研读了每个数据集的原始论文，提取相应的元数据，包括出版信息、数据描述、实验设计、样本和数据可用性等。单细胞空间转录组于数据集中来自不同组织、处理方法的样本或生物技术复制品，研究团队将其手动划分为305个子数据集。所有收集的数据集和研究结果均有文章发表。可用于可视化和比较空间分辨下的转录组数据。该数据库提供的空间差异表达基因及丰富的功能注释，有助于进一步数据分析。组织细胞的空间结构提供了一个资源库，并为了解疾病中的细胞微环境带来新的见解。目前，空间转录组可从获得，无需注册或登录。人类细胞图谱计划的主要目标之一是表征所有细胞类型的空间关系，同时基于表达特征在空间上映射多种细胞类型可能的相互作用。江苏空间转录组有什么用10X Visium空间转录组的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。
空间转录组是在组织原位检测基因表达的一种技术，与bulk RNA-seq或单细胞转录组测序相比，空间转录组避免了组织中细胞位置信息的丢失，使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。正是由于空间转录组可以从多维度解析生物学过程的特点，近年来关于空间转录组无论是在技术开发，还是大规模应用或商业化，都得到蓬勃发展。例如2019年4月，Science发文通过空间转录组揭示ALS（肌萎缩侧索硬化症，又称渐冻症）分子病理的时空动态；2019年8月，Nature在线发表了景乃禾团队解析小鼠早期胚胎细胞的时空表达数据；2020年9月，Cell上发表了一篇利用空间转录组解析人鳞状细胞*的文章；2021年1月，Science发表了将组织扩展和原位RNA测序结合起来的新型空间转录组技术ExSeq；2021年4月，10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空间转录组商业化解决方案。
空间转录组数据分析的重要是根据每个芯片上每个spot的基因表达信息进行聚类，然后将spot根据坐标位置序列放回到组织的图像上，同时可以对每个gene在组织上表达的空间位置进行定位。获得测序数据后，首先利用Space Ranger 软件可以自动化的对图像进行处理、数据比对和Barcode处理。另外一个软件Loupe Cell Browser是一个适用于Windows和MacOS的桌面应用程序，它可以快速、轻松地可视化和分析10X Visium数据。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取， 如空间转录组技术。
如果只是通过空间转录组或者单细胞转录组，研究人员在两个样本中均可以发现淋巴细胞相关基因或者淋巴细胞群，无法解释两个样本预后之间的差异。但是通过空间转录组，就能很清晰看到两个样本之间的差异。作者借助空间转录组测序技术探究人类心脏在发育过程中的基因表达特征和细胞图谱变化，发现对于每个发育阶段的不同解剖区域，都有独特的基因表达特征。结合单细胞转录组测序技术，作者进一步确定和丰富了胚胎心脏基因表达的空间注释信息。 空间转录组使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。江苏空间转录组有什么用
作者通过对三个人类脑皮层组织的空间转录组测序，可评估不同脑皮层区域中基因表达特征和细胞类型定位情况。江苏空间转录组有什么用
空间转录组的应用有哪些？一、发现疾病的空间异质性：同时了解患病组织中的细胞类型及其定位有助于解决空间分辨的转录组学问题。在不同的环境下，明智地选择这些方法在生物学研究中也是至关重要的，例如在神经科学中，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法适用于小样本（例如临床样本）以及整个转录组或基因组分析。二、构建空间转录组图谱：借助于空间分辨的单细胞转录组学，建立图谱可能是在分子水平上研究生物体结构的重要步骤。目前的多项研究通过单细胞转录组技术结合空间转录技术，得到多个***的时空转录组图谱（相关研究后续会在如下专辑更新）。江苏空间转录组有什么用
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