研究测序pri-miRNA

案例3：拟南芥m5CRNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响原文：Transcriptome-WideMappingofRNA5-MethylcytosineinArabidopsismRNAsandNoncodingRNAs期刊：ThePlantCell影响因子：8.23与上篇不同，本研究团队采用m5CRNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱，在种子，幼芽，根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNAm5C甲基转移酶TRM4B，造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短，同时对氧化的应激反应更敏感。在RIP-Seq中，富集峰表示全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。研究测序pri-miRNA

目前对m6ARNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术，云序生物提供成熟m6ARNA甲基化MeRIP-seq服务，技术原理如下：将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA的片段，并不添加RNA甲基化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本（Input）中的序列片段，将RNA甲基化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中RNA甲基化程度。修饰测序环状RNA云序生物采用商业化RIP试剂盒，保证了RIP实验的成功率和稳定性。

mRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内首批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务，利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA的 片段上 m6A 修饰的信号干扰，选择性地获取 mRNA 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序，可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据，进而揭示差异性 m6Am 修饰位点的特征及其可能的生物学功能，为您的科研课题提供强劲的助力。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。

云序优势 适用于血清血浆等微量样品： 此法减少DNA损失，并保留原始表达量，不同环状DNA间表达量比较更准确 专业的生物信息学分析： 专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。 一站式服务： 客户只需提供血清血浆，云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型： 血清血浆。 样品量： 血清血浆：5mL 样品运输及保存： EDTA抗凝，样品干冰运输。勿用肝素管取样（绿色盖子抗凝管）。云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱。

m6ALncRNA测序：案例上的m6A甲基化影响细胞分化原文：N6-MethyladenosinemodificationoflincRNA1281iscriticallyrequiredformESCdifferentiationpotential期刊：NucleicAcidsResearch影响因子：11.56同济大学康九红团队研究发现在mESC细胞中，甲基化转移酶Mettl3能够调控lincRNA1281发生甲基化，并且与干细胞分化能力直接相关。揭示此过程主要发生在胞浆，且由let-7能够竞争性结合linc1281，从而降低其表达量，从机制上解释了m6A在不影响到表达水平的情况下如何影响生物学功能的问题。云序优势 适用于任何物种：可以检测几乎任何动植物的环状RNA。中国香港测序环状RNA

云序生物对ac4C RNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术。研究测序pri-miRNA

案例2：2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病 毒逃避宿主细胞免疫识别机制 原文：FTSJ3 is an RNA 2’-O-methyltransferase recruited by HIV to avoid innate immune sensing 期刊：Nature 影响因子：41.6 外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合，形成复合物，因此推测，FTSJ3是一种2'-O-甲基化转移酶。接着，体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIV RNA上的2'-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段，证实在HIV病 毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2'-O-甲基化修饰。综上，该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病 毒RNA发生2'-O-甲基化从而解释了HIV病 毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。研究测序pri-miRNA

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