三氟乙酸主要用于新型农药、医药和染料等的生产，在材料、溶剂等领域也有较大的应用开发潜力。三氟乙酸主要用于合成多种含三氟甲基和杂环的除草剂，可以合成多种带有吡啶基、喹啉基的新型除草剂；作为极强的质子酸，它应用于芳香族化合物烷基化、酰基化、烯烃聚合等反应的催化剂；作为溶剂，三氟乙酸是氟化、硝化及卤代反应的优良溶剂，特别是其衍生物三氟乙酰基对羟基和氨基的优良保护作用，在氨基酸和多肽化合物合成方面有着非常重要的应用,用于多肽合成中除去氨基酸的叔丁氧羰基（t-boc）保护基；三氟乙酸作为制备离子膜的原料和改性剂，可大幅提高烧碱工业电流效率，延长膜的使用寿命；三氟乙酸还可合成三氟乙醇、三氟乙醛和三氟乙酐。室温下三氟乙酸汞使氟苯起汞化反应（亲电取代），也可将腙转化为重氮化合物。此酸的铅盐可将芳烃转化为酚。三氟乙酸在水中发生离子化，呈强酸性，能形成稳定的金属盐或酯。北京农药中间体三氟乙酸电子级作用
在反相色谱分离多肽和蛋白质的实验中，使用三氟乙酸（TFA）作为离子对试剂是常见手段。流动相中的三氟乙酸通过与疏水键合相和残留的极性表面以多种模式相互作用，来改善峰形、克服峰展宽和拖尾问题。三氟乙酸与多肽上的正电荷及极性集团相结合以减少极性保留，并把多肽带回到疏水的反相表面。以同样的方式，三氟乙酸屏蔽了固定相上的残留的极性表面。三氟乙酸的行为可以理解为它滞留在反相固定相的表面，同时与多肽及柱床作用，这已在之前有所报导。北京生化试剂三氟乙酸电子级分子式三氟乙酸是有机强酸，具有吸湿性和严重的腐蚀性，特别是对黏膜组织具有很强的损伤性，要避免吸入呼吸道。
有一种三氟乙酸酐的合成方法，先在反应釜分散五氧化二磷并降温，再快速加入三氟乙酸，回流反应后开始常压蒸馏，之后适时滴加入高沸点酸，使反应体系溶解澄清，同时保持常压蒸馏，直至三氟乙酸酐被完全蒸馏出来。本方法能克服三氟乙酸反应不完全、三氟乙酸酐蒸馏不完全的技术问题，收率高（至少95.5%），且产品纯度高（至少99.3%）；该方法简化了生产操作，能保证在大生产上实现工艺正常运行，并保证流畅性；产品无需精馏，避免以往合成方法产品需要分离原料和产品的麻烦，节约了成本。
三氟乙酸防治手段：皮肤接触：立即脱去污染的衣着，用大量流动清水冲洗至少15分钟，就医。眼睛接触：立即提起眼睑，用大量流动清水或生理盐水彻底冲洗至少15分钟，就医。吸入：迅速脱离现场至空气新鲜处，保持呼吸道通畅，如呼吸困难，给输氧。如呼吸停止，立即进行人工呼吸，就医。食入：用水漱口，给饮牛奶或蛋清，就医。工程控制：密闭操作，注意通风，提供安全淋浴和洗眼设备。呼吸系统防护：可能接触其蒸气时，必须佩戴导管式防毒面具或自吸式长管面具，紧急事态抢救或撤离时，建议佩戴空气呼吸器。三氟乙酸不燃。受热分解或与酸类接触放出有毒气体。具有强腐蚀性。
除了作为反应的溶剂，三氟乙酸因为其较好的溶解性，在高效液相色谱中常常被用作流动相，用来分离一些难以区分的化合物，在化合物核磁共振检测中，也常常利用氘代三氟乙酸作为溶剂，用来区分一些诸如卟啉类的大环分子内的氢的变化。三氟乙酸除了作为反应的催化剂和溶剂之外，还是很好的保护剂和脱保护剂，作为保护剂常用来保护氨基和羟基，作为脱保护剂，经常用来脱Boc；此外，三氟乙酸还可以用来制备合成一些三氟乙酸衍生物，例如三氟乙酸酐，它是一种重要的中间体，在医药、农药等化学合成中有很好的用途，市场前景广阔。三氟乙酸的生产主要集中在欧洲、北美、印度和中国，其中国内三氟乙酸的产能约占全球的一半，主要集中在浙江、山东、江苏等地，三氟乙酸在未来一段时间仍将是化工领域的宠儿。对三氟乙酸进行操作时应该在通风橱中进行，佩戴橡胶手套，防止接触性腐蚀，比较好佩戴呼吸器。深圳医药三氟乙酸电子级作用
三氟乙酸可以与碱反应生成相应的三氟乙酸盐。北京农药中间体三氟乙酸电子级作用
与水相比，TFA具有更低的表面张力。这是由TFA中的三个氟基团引起的，它们相互排斥。你几乎可以说TFA在某种程度上讨厌自己。如果没有稳定溶剂例如水的添加，“爬行”液体沿容器壁向上形成TFA蒸气，并导致了一个或多个物质的溶解，如果多个样品同时蒸发，例如使用微量滴定板时，这种情况会导致材料泄漏或交叉污染。因此，在从样品制备到放置以及蒸发后的所有阶段使用高浓度的TFA时，必须小心。TFA的蠕变通常可以通过用水稀释(40%v / v)来限制。北京农药中间体三氟乙酸电子级作用
