三氟乙酸(TFA)在有机合成中是多功能的，他们比较有用的特性包括挥发性，在有机溶液中的溶解度和高酸度。然而，由于其“爬行”特性，去除TFA残留物可能是危险的。用TFA作为溶剂或酸催化剂进行许多化学转化，包括重排，官能团脱保护，还原，缩合，氢化芳基化，三氟甲基化和溶剂分解反应。但是，使TFA成为一种有用的工具的一些功能在去除不需要的残留物时会成为问题。由于该有机酸的其他试剂去除方法受损，大部分TFA被蒸发。所以需要采取一些必要的预防措施来去除TFA残留物。三氟乙酸应储存于阴凉、通风的库房，远离火种、热源，库温不超过32℃，相对湿度不超过80%，保持容器密封。华北农药中间体三氟乙酸电子级
三氟乙酸防护手段：身体防护：穿橡胶耐酸碱服。手防护：戴橡胶耐酸碱手套。其他防护：工作现场禁止吸烟、进食和饮水，工作完毕，淋浴更衣，注意个人清洁卫生。灭火方法：灭火剂用干粉、砂土，禁止用水和泡沫灭火。应急处理：迅速撤离泄漏污染区人员至安全区，并进行隔离，严格限制出入；建议应急处理人员戴自给正压式呼吸器，穿防酸碱工作服，不要直接接触泄漏物，尽可能切断泄漏源。小量泄漏：用砂土或其它不燃材料吸附或吸收；也可以将地面洒上苏打灰，用大量水冲洗，洗水稀释后放入废水系统。大量泄漏：构筑围堤或挖坑收容，用泡沫覆盖，降低蒸气灾害，用泵转移至槽车或特殊收集器内，回收或运至废物处理场所处置。 北京化工原料三氟乙酸电子级CAS号三氟乙酸可作为很多重排反应的催化剂，例如，它可以催化环氧化合物的开环、Cope重排等化学反应。
三氟乙酸（TFA）普遍用于合成多肽的工艺中作为切割剂及脱保护剂，临床使用存在毒性。目前我国药典将其纳入需控制的溶残，归为四类溶剂，但对其控制限量尚无明确规定，通常按三类溶剂的限度0.5%限定。多肽药物固相合成中，对于合成含有半胱氨酸、组氨酸、精氨酸、等带侧链功能基的氨基酸多肽来说，为了避免由于侧链功能团所带来的的副反应，一般需要用适当的保护基将侧链基团暂时保护起来。保护基的选择既要保证侧链基团不参与形成酰胺的反应，又要保证在肽合成过程中不受破坏，同时又要保证在后面的肽链裂解时能被除去。因使用TFA将肽链从树脂上切下的同时能对R侧链的保护基进行脱保护，且不同侧链对应的不同保护基，基本都能用TFA进行去保护，故目前几乎所有固相合成工艺均会在工艺中使用TFA。
在一些反应中，三氟乙酸作为母液需要回收，其重要目的是为了出去其中的水分，但由于三氟乙酸易与水形成共沸物，因此不能采用蒸馏的方法进行分离。参照三氟乙酸纯化工艺，将三氟乙酸母液制成钠盐，然后再用浓硫酸酸化，蒸出三氟乙酸。在中和反应中，放热较小，但由于反应会产生大量的二氧化碳气体，所以，过快的滴加速度将导致二氧化碳浓度瞬间增加，体系有产生憋压的可能。三氟乙酸钠易溶于水，在过滤中容易吸收空气中的水形成过饱和溶液而堵塞滤孔并流失，所以较好的方法是蒸除大部分水后，直接进行干燥处理。它是有机反应的优良溶剂，如喹啉在一般溶剂中催化氢化时，吡啶环优先氢化，但在三氟乙酸中苯环优先氢化。
在三氟乙酸的制备过程中，难免会带入一些杂质，其中一种三氟乙酸的除氟工艺，是向反应釜中加入含氟三氟乙酸和过量的活性氧化铝，其中，三氟乙酸中的含氟杂质与活性氧化铝进行络合反应，所述络合反应生成的氟化铝络合离子吸附在剩余的活性氧化铝表面；除去氟后的三氟乙酸在连续蒸馏出反应釜并冷凝收集，同时向反应釜内连续加入含氟三氟乙酸额活性氧化铝以使反应釜内液位保持恒定，吸附了氟化铝络合离子的活性氧化铝由反应釜的釜底抽出后经过过滤器过滤除去，滤液循环回到反应釜内。但该方法步骤较多，成本相对较高，如何找出经济有效的纯化方法，是今后的研究重点。三氟乙酸还可以用于有机合成中的氧化反应和脱水反应。华北有机化合物三氟乙酸电子级作用
三氟乙酸可以氧化许多有机物，如醇、醛和酮等，从而实现有机合成的目的。华北农药中间体三氟乙酸电子级
将聚3‑羟基丁酸酯、醇和三氟乙酸溶液混合后进行反应，反应结束后通过两步蒸馏工艺实现产物和溶剂的分离与溶剂回收。解决了现有技术中聚3‑羟基丁酸酯降解制备R‑3‑羟基丁酸酯时存在的后处理工艺步骤多、所需化学品种类多且能耗高、催化剂难以回收利用以及成本高的技术问题，实现了反应产物制备和分离过程无需引入额外化学试剂、通过两步蒸馏工艺得到R‑3‑羟基丁酸酯类化合物产品以及实现催化溶剂体系的高效回收循环利用，具有工艺简单、操作方便的特点，表现出潜在的工业化应用价值。华北农药中间体三氟乙酸电子级
