中文标题:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代谢的机制:多组学提供的见解研究对象:小鼠发表期刊:FrontiersinNutrition影响因子:6.576发表时间:2022年1月11日合作单位:北京中医药大学健康培养教育部重点实验室,北京中医药大学健康栽培北京市重点实验室,北京中医药大学科学技术系运用组学关键技术:转录组学、DIA蛋白组学、PRM靶向蛋白验证(皆由欧易/鹿明生物提供技术支持)。目前,改善饮食被认为是**安全有效的***和预防代谢性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂属植物八角肉桂和桂皮)及其成分被证明具有多种***作用,包括抗糖尿病、减轻体重、低脂血症和增强胰岛素敏感性。因此,使用膳食补充剂和来自肉桂的化学物质来控制血糖和血脂可能成为***代谢类疾病的新方法。一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。北京蛋白组学和基因组学的差异
iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法:2021年4月,南京林业大学喻方圆教授(一作:吴岐奎)课题组在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊发表了题为“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通过转录组学+iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法,分析东京野茉莉种子发育过程中脂肪酸生物合成相关基因的表达趋势,确定油脂积累的主要影响因子并构建其调控网络。为野茉莉属植物种子油用研究和后续功能分析研究提供了一定的研究基础。山东itraq定量蛋白组学蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。
通过磷酸化蛋白质组定量鉴定了1244个磷酸化蛋白质,其中474个(38%)在**组织中***增加,183个(15%)***下降。三种蛋白亚型中磷酸化蛋白组学的比较结果揭示了亚型特异性的活性激酶。进一步对差异改变的磷酸化位点的研究显示,在S-I中观察到参与黏附的底物升高和参与RNA转运的底物减少。而基于timsTOF Pro离子淌度4D蛋白质组技术,是对蛋白组学+磷酸化组学的双重升级,可实现快速采集、更高的灵敏度和特异性,**临床蛋白质组学在定性数量更多、定量更准确、位点鉴定更精确、样本需求量更低、检测周期更短等性能上***提升,从蛋白质表达和修饰双重角度更好地发挥发掘分子调控机制、发现疾病分子分型以及发掘生物标志物等多重作用。
作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较,同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中,普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中,参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性,以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的,作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白组学,研究方法,高通量定性定量研究,有。
TMTpro-16plex等标记试剂已经发布一年,广受科研工作者喜爱。但是,对于6组3重复、3组6重复的实验设计,16plex却难以满足。TMTpro™ 18-plex标记蛋白组会是更好的选择方式。其中基于质谱仪平台的蛋白组学近年来备受青睐,稳定同位素标记策略也被广泛应用于多重定量蛋白质组学中。鹿明生物推出Thermo Scientific™ TMTpro™ 18-plex标记蛋白组,18个样本以内,可实现一次标记和分级,避免了多批次标记引入的批次效应,能***提升样本的数据质量。同时对更多蛋白质鉴定和定量,提供了样本的多通路处理水平。这个技术可谓是2021年的又一创新技术。单细胞组学 单细胞蛋白组学 蛋白质组学 。天津蛋白组学定量值表
蛋白组学常见研究模式,蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读。北京蛋白组学和基因组学的差异
运用生物技术:磷酸化蛋白质组学(欧易鹿明提供):2022年1月,***医学研究院生物工程研究所钟辉研究员、魏从文副研究员和秦成峰研究员,广西医科大学附属**医院吴飞翔教授等为共同通讯作(一作:万禄明、邓永强、柯跃华、麻恩浩、杨欢、林浩天)在Nature Metabolism期刊发表的题为“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通过磷酸化蛋白质组学、LC-MS靶向代谢组学等研究方法,发现了一个全新的糖异生调控***——GP73,***会诱导GP73的产生和分泌,从而导致过度的糖异生。北京蛋白组学和基因组学的差异
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