4D蛋白质组学分析发现,不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加,补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关;通过COVID-19和健康组对比,发现了49%的差异分析物;和脓毒症相比,G-CSF,IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低;蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术,确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素,并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。空间蛋白质组学技术,开辟了解析组织微环境、组织生物标记物开发、疾病诊断与预后、等领域全新的研究视角。浙江修饰蛋白组学鉴定
蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学研究案例:2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。山东蛋白组学代谢组学多少钱一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。
通过蛋白质组学质谱鉴定、PRM靶向鉴定、iTRAQ标记定量蛋白组学等研究方法,发现了N-豆蔻酰化在肝脏**发生中发挥重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**发生的NDP,并通过干扰泛素化来刺激促**发生的NUP机制。为靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理论依据。中文标题:NMT1依赖于POTEE发生N-豆蔻酰化并通过差异调节靶标的泛素化来刺激肝脏**的发生研究对象:细胞、小鼠、人**组织发表期刊:FrontiersinOncology影响因子:6.244发表时间:2021年5月合作单位:上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心运用生物技术:iTRAQ标记定量蛋白组学、PRM靶向验证、质谱鉴定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持
为了验证iTRAQ标记蛋白组学分析测定的蛋白积累变化,选择两种蛋白进行westernblot分析。如图4A所示,iTRAQ分析中两种蛋白(RPD3和VMA3)的积累每次均与westernblot数据一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相对表达量与蛋白水平相似,在BF的菌丝中也表达上调(图4B-D)。VAC8在2-1、3-1、4-1组的基因水平上高度上调。这些结果表明,这些上调的表达蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用标记定量(iTRAQ)蛋白质组学、基于气相色谱-质谱的代谢组学GC-MS非靶向代谢组学和透射电镜分析细胞结构,研究了香菇菌丝后熟转色形成的机制,并且***证明氧化应激和自噬过程是至关重要,为后续进一步的研究提供了新的见解。蛋白质组学,开启医学新篇章,助力人类健康。
运用生物技术:磷酸化蛋白质组学(欧易鹿明提供):2022年1月,***医学研究院生物工程研究所钟辉研究员、魏从文副研究员和秦成峰研究员,广西医科大学附属**医院吴飞翔教授等为共同通讯作(一作:万禄明、邓永强、柯跃华、麻恩浩、杨欢、林浩天)在Nature Metabolism期刊发表的题为“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通过磷酸化蛋白质组学、LC-MS靶向代谢组学等研究方法,发现了一个全新的糖异生调控***——GP73,***会诱导GP73的产生和分泌,从而导致过度的糖异生。蛋白组学蛋白质组学-一站式解决蛋白质组学难题。天津蛋白组学ppt
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蛋白质组学研究方法研究案例:2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。浙江修饰蛋白组学鉴定
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