酵母双杂交、GSTpull-down实验显示,SWC6可以直接与HY5、HYH相互作用(图A-C)。pull-down实验显示ARP6同样可以与HY5、HYH相互作用(图D)。split-LUC、Co-IP实验证实HY5可以与SWC6、ARP6结合(图E-J)。下胚轴表型分析显示,蓝光下arp6hy5hyh三突变体下胚轴长度明显大于arp6突变体、hy5hyh双突变体,表明ARP6和HY5有可能通过不同途径调控下胚轴的发育。Semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验显示,蓝光下,在 CRY1 存在下,SWC6 与 ARP6 的结合***增强。表明蓝光***的 CRY1 可能通过蓝光依赖的 CRY1-SWC6/ARP6 相互作用增强 SWC6 与 ARP6 的结合。酵母文库"酵母"和"文库"有什么不同。湖南生物技术酵母文库
苹果酵母文库:黄酮醇是一类重要的次生代谢产物,在防治人类**、*******、****血脂、抗氧化、抗病毒、抗过敏等方面发挥着重要作用。苹果除了含有多种维生素之外,还富含黄酮醇,这是"一日一苹果,医生远离我"的重要原因。了解黄酮醇的生物合成调控对改善苹果果实品质、提高苹果营养价值和提高苹果环境适应性具有重要意义。2022年2月,南京农业大学汪良驹团队在国际期刊分子科学上发表了题为“MdSCL8asaNegativeRegulatorParticipatesinALA-InducedFLS1toPromoteFlavonolAccumulationinApples”的研究论文,该研究发现MdSCL8作为MdFLS1的新调节因子,在ALA诱导苹果黄酮醇积累的过程中发挥负调控作用。该项目中所用的苹果酵母文库由欧易生物构建。青海什么是酵母文库做什么百种酵母文库,让您的科研不再困难!!
通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。
酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。众所周知,酵母杂交技术存在一定的假阳性。
欧易酵母文库助力小麦根长抑制分子机制研究,近日,中国农业科学院作物科学研究所景蕊莲研究员、河南农业大学王翔副教授为共同通讯作者,在 Journal of Experimental Botany 杂志(IF: 6.992)在线发表了题为“小麦短根长度 1文章中酵母双杂交文库由欧易生物完成。本研究从小麦中克隆了一个新的 ERF 转录因子基因 TaSRL1 (SHORT ROOT LENGTH 1),该基因主要在根中表达。综上,本研究证明了 TaSRL1 在生长素依赖途径中作为 taPIN2 的直接调控因子,并通过与 TaTIFY9 相互作用,整合生长素和 JA 信号,抑制根的生长。TaSRL1-4A 标记对小麦根系、株形和产量的改良具有重要意义。文章中酵母文库实验由欧易生物完成。上海建库酵母文库做什么
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小欧从2018年即开始关注酵母杂交与高通量测序相结合的技术发展,如2017年CaoGang老师等发表的RLL-Y2H技术,实现了文库筛文库可能,该技术通过对酵母双杂常用载体的改造,并结合高通量测序,可直接获得AD-BD互作蛋白对。所用方法相当巧妙,感兴趣的同学请点击《当酵母双杂交遇到高通量测序》。钮老师团队之前的研究已经鉴定了DAL1作为一种保守的针叶树年龄生物标记基因,在油松从营养生长到生殖生长的时相转变过程中起重要作用。为了进一步理解年龄效应如何驱动针叶树的发育,阐明与DAL1相关的蛋白互作网络很关键。钮老师团队利用传统的Y2H筛选技术结合NGS测序技术,优化得到了Y2H-seq技术,与传统的筛选测序相比,大幅度节省了时间和实验成本。湖南生物技术酵母文库
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