GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。浙江代谢组学方法与应用pdf
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。江苏代谢组学比较好的公司助力靶向/非靶向代谢组学研究,适用于植物,动物,血清,尿液等多种生物样本。
代谢组学等多组学研究,2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象:大鼠发表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子:6.529发表时间:2022年2月合作单位:中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS+GC-MS双平台代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时,也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS双平台代谢组学有助于对中药成分进行***的分析,为药物机制提供参考。读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。
双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献,为署名作者。**话代谢、代谢组学实验设计、数据解读分析、数据库介绍及使用流程。北京代谢组学网络分析
代谢组学生物解析 非靶代谢组学研究 靶向代谢组学研究。浙江代谢组学方法与应用pdf
非靶向代谢组学研究:对于代谢物分析,作者对非靶代谢组学测定,共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性(VIP)>1和p<0.05的筛选标准,在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物(DAM)(表1)。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段,发现S3的DAM比S1和S2更丰富,这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后,利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中,参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大,包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯酸”。浙江代谢组学方法与应用pdf
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