定量蛋白质组学研究:2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《FrontiersinMicrobiology》期刊发表的题为“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。涉及的欧易/鹿明生物服务产品:iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学蛋白质组学ppt 蛋白组学测序一个多少钱。广东itraq 蛋白组学
采用RNA-Seq转录组学分析和DIA蛋白质组学分析,研究了AC和AL对db/db小鼠的影响。转录组分析共鉴定出16812种不同的蛋白质编码转录本。其中,2837个(约16.9%)在正常组和对照组之间有***差异,表明db/db小鼠在转录水平上与野生型小鼠***不同。与对照组相比,共有3749个基因因摄入AC而发生***改变(2201个下调,1548个上调),560个基因(430个下调,130个上调)因摄入AL而发生***改变(图3B)。DIA蛋白质组学分析鉴定出2729种蛋白质。正常组和对照组之间共发现1059个(约占总鉴定蛋白质的38.8%)DEPs,AC处理有230个蛋白质发生***变化(109个上调,121个下调),AL处理有211个蛋白质发生***变化(116个上调,95个下调)。江西蛋白组学质谱检测原理修饰蛋白质组试剂及服务,蛋白质组学解决方案。
作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较,同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中,普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中,参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性,以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的,作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。
蛋白质是生命功能的直接体现者,近几年来,蛋白质组研究越来越多的体现在多种疾病机理的阐明,为科研问题攻克提供理论根据和解决途径。通过蛋白质组比较分析,找到特异性的蛋白,成为新药物设计的分子靶点,为疾病的早期诊断提供分子标志。然而生物体内的蛋白组学是一个非常复杂的体系。近几年来,由于质谱技术的发展,让我们对生物体内蛋白组的认识更加***和准确。尤其基于TimsTOF Pro系列质谱仪,被称为4D蛋白组学技术为蛋白组学提供全新的覆盖深度和通量,为精细医疗提供**技术支持力量。欧易生物、鹿明生物助力您的4D蛋白组学研究。单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。蛋白质组学生物标志物&机制研究一站式服务。广东植物蛋白组学背景
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通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs,在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外,热图分析揭示了不同表达的功能基因,包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明,HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关,增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力,因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述,结果证实了M-Exos诱导了人脑微血管内皮细胞的功能改变。广东itraq 蛋白组学
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