空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法。湖南空间代谢组学技术怎么应用
进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正常白质组织,旨在获得与患者再髓鞘病变相关的特定脂质谱(图6D−1)。通过串联质谱法确认鉴定的脂质,并在表2中报告。正如在小鼠组织分析中所观察到的,再髓鞘化区域主要在PC和PE脂质群的组成上不同。结果表明,HSL成像可以有效地用于多发性硬化患者死后病变的脂质谱分析,并表明多发性硬化患者再髓鞘化过程中产生的髓鞘与附近正常出现的白质相比具有改变的脂质谱。(a)正常白质(NAWM)和有髓鞘病变的平均拉曼光谱±1标准差(SD)。(b)平均差谱±1SD(NAWM−再髓鞘损伤)在结构水平显示再髓鞘过程。(c)基于有髓损伤的拉曼光谱的P***A后验概率图像突出NAWM(绿色)和有髓组织(红色)。湖南空间代谢组学技术怎么应用空间代谢组学所解决的科研问题。
空间代谢组学:绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像,直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓,但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羟基丁酰肉碱,HE=苏木精和伊红,LPC=溶血磷脂酰胆碱,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称为结直肠异常)与正常健康个体。空间代谢组性价比高.拥有专业技术团队。
1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示,将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描,并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图,在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像,在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明,AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm,代谢物质量比较大差异为0.001Da,同一物质的检测动态范围高达1000倍。如图1所示,通过AFADESI-MSI可在大鼠脑部检测到一些呈特征性分布有代表性的极性代谢物,其强度范围从0到104甚至到106。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。陕西空间代谢组学质谱
空间代谢组三个维度的分析。湖南空间代谢组学技术怎么应用
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。湖南空间代谢组学技术怎么应用
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