合肥BD单细胞测序

现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是基于微流控通道的细胞与Beads的在通道内的动态结合，通过油相水相不相容的特点将结合了的细胞和Beads进行分隔，在这个空间，单个细胞的内容物释放，转录本或其他生物分析物被标记或添加索引，以便下游识别。BDRhapsody单细胞测序平台采用静态微孔技术（Cyto-Seq具有类似的技术原理）。通过微孔板的物理分隔，将一个个单个细胞和带有标签的磁珠，一对一的“框”在微反应的物理平台中。这样，每一个细胞都会结合一个磁珠，那么在每一个磁珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，这个抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探针结构，精细区分上万个细胞中mRNA的来源及表达丰度。合肥BD单细胞测序

关于单细胞测序实验样本制备，这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致，也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤，以确保您的样本有适当浓度的活细胞，并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要，您还可以使用抗体对样本进行染色，标记细胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤，具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小，以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何，所有样本类型都遵循同一个基本原则，那就是生成高质量的单细胞悬液。single cell RNA单细胞多组学测序测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。

单细胞测序结果动辄上百G数据量，庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求，首先针对下机数据的质控环节：单细胞测序产生数亿的结果序列，不可避免的会出现低质量的测序结果，存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征，即碱基测序结果的错误率在1%/0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性，为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。

针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。

单细胞获得困难，不同组织要求不尽相同难以搞定？烈冰2000+项目消化经验，100+组织类型解离protocol，精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系，确保单细胞的获得。冻存样本无法实验，珍贵样本无法使用？烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术，确保冻存组织使用。珍贵样本，细胞数量太少，消化背景杂无法做单细胞？采用国际认可的10XGenomics，BDRhapsody双平台模式，根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少，背景杂也能做单细胞。单细胞RNA分类精度不足，部分细胞无法细分？烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术，真正做到从上游到下游的全流程检测，确保超高的细胞分类精度。烈冰生物为您提供多平台一站式全流程BD单细胞测序服务。BD VDJ单细胞测序

烈冰测序服务已助力300余篇国际期刊研究文章发表。合肥BD单细胞测序

烈冰生物为您的实验定制工作流程：对于不同用户和实验，单细胞实验工作流程往往需要不同程度的样本操作、质量和通量。BD仪器选项可以根据具体需求进行配置。烈冰生物搭建BDFACS流式分选平台（如BDFACSMelody），是上游样本富集的良好选择。此外，我们具备BDRhapsody单细胞成像仪提供自动化细胞计数和细胞样本活性测试，帮助用户制备适用于Cartridge微孔板单细胞捕获浓度的样本。扫描仪提供了微孔板上磁珠捕获细胞的计数。BDRhapsody样品上样工作站轻巧便携，可在实验室内轻松移动。搭配烈冰倾情研发多年的成果NovelBrain生物信息大数据分析系统，完成测序数据的生物信息分析和结果可视化呈现。这些工具包括UMI分析算法和可视化工具，即使没有经验的用户也可分析和理解单细胞数据。合肥BD单细胞测序

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