由于硬骨鱼和人类在骨骼发育过程中的基因、信号通路有高度同源性，而且与其他的动物模型相比，斑马鱼具有个体小适合高通量化学筛选、幼鱼身体透明易于观察骨骼发育的特点，所以近年来以斑马鱼为模型的骨骼研究逐渐成为这一领域的热点。斑马鱼从前向后的脊椎发育过程是非连续的，而是分成两个不同的区域：前域（包括第3块椎骨）和后域（包括第4-31块椎骨）。将斑马鱼脊椎骨钙化过程分成两个不同区域是基于第2和第3椎骨的出现晚于第4椎骨。我们利用斑马鱼骨骼发育的规律，摄入生长发育促进剂的斑马鱼脊椎骨发育会加快。脊椎骨染色应用与钙特异性结合的荧光染料（呈绿色），经荧光显微镜观察脊椎骨的数量。斑马鱼模型评价胚胎毒性。评价药物安全性费用
利用斑马鱼模型评价生殖毒性。斑马鱼成鱼体长5cm左右，其胚胎透明，在受精72h后完成孵化，并在孵出后3个月内性成熟。成年斑马鱼的繁殖周期短(一般7d左右)，若条件适宜，成年雌性斑马鱼可定期产卵(每次200～300个)。在斑马鱼的早期胚胎及幼体的发育过程中，尚无性别分化，原始性腺都是相同的且具有双向发育的潜能，易受环境(温度、光照、pH值等)因素的影响而改变其遗传性别。对于雌性斑马鱼而言，产卵量是评价其繁殖力的常用生物指标，它与鱼类繁殖过程中的多个环节（卵子发育、雌雄交配行为等）相关，并对环境化学物质具有高敏感性，能直接反应鱼类繁殖力变化。环境化学物质除了直接对亲代斑马鱼的生殖系统造成损害，还可能对其子代的正常生长发育皮肤抑菌试验斑马鱼评价胃肠道粘膜损伤辅助保护功效。
贫血是指人体外周血红细胞容量减少，低于正常范围下限的一种常见的临床症状。溶血性贫血是由于红细胞的破坏增速、增多，超过造血补偿能力范围时所发生的一种贫血。斑马鱼造血系统的形成，包括红系、髓系、淋系及巨核系为主的造血系统，其相关的转录因子及信号转导通路同人类有高度的同源性，这些特点使斑马鱼在人类造血系统和血液疾病的研究中有着更加大量的应用。研究表明，苯肼是一种溶血剂。苯肼作用于红细胞膜，加速膜表面亮氨酸、赖氨酸及组氨酸的水解，使大量红细胞迅速遭到破坏；同时可选择性地氧化膜骨架和α珠蛋白，并将磷脂酰丝氨酸易位至红细胞表面，导致红细胞变形性降低，增强红细胞黏附到细胞外基质的能力从而破坏循环血中的成熟红细胞，使血红蛋白变性聚集、形成Heinz小体，使得红细胞的破坏速度远大于机体红细胞再造的能力，导致机体发生溶血性贫血。用邻联茴香胺染色法对红细胞进行特异性染色（呈红色），贫血斑马鱼心脏部位的红细胞较正常斑马鱼明显减少。由于斑马鱼早期出现血液循环时胚胎透明，在解剖显微镜下可以观察到。
利用斑马鱼模型评价抗气滞血瘀型血栓作用【评价原理】斑马鱼的基因与人类基因的相似度达到87％，斑马鱼血液系统与人类血液系统的血小板和凝血因子有许多共同点。大剂量肾上腺素（AH）能够引起动物血管内皮损伤和血小板活性增强，造成体内处于高凝状态。肾上腺素的大量增加模拟人体暴怒、大怒，导致气机阻滞，气滞血瘀。经过特异性红细胞染色（邻联茴香胺染色），患有血栓的斑马鱼在尾部静脉会布满红细胞，可以明显被观察到。本实验证实了阿司匹林和氯吡格雷具有明显抗血栓作用。利用斑马鱼模型评价镇痛作用。
随着电子产品的大量使用，用眼的时间和强度已远超过去，用眼过度引起一系列视力问题。研究表明，高度近视、视网膜疾病、白内障、眼干燥关节综合征均与眼细胞凋亡相关。斑马鱼的眼部血管结构跟人非常相似，斑马鱼视网膜结构也跟人高度相似。用霉酚酸吗啉乙酯可以诱发斑马鱼眼细胞凋亡，模拟人的眼部疾病。用特异性荧光染色（呈绿色），患有眼疾的斑马鱼眼细胞凋亡较正常斑马鱼明显增多，在荧光显微镜下可以观察到。经过每组30尾斑马鱼的对比实验，眼保护剂组斑马鱼眼细胞与正常对照组相似，并未出现模型对照组的大面积细胞凋亡情况。斑马鱼模型评价肾脏毒***物有效评价
斑马鱼评价炎症反应作用。评价药物安全性费用
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