斑马鱼消化道的解剖结构和细胞结构与人类消化道相似，具有同心圆层的内上皮、结缔组织、环状肌肉和外纵肌层。三硝基苯磺酸（TNBS）的乙醇溶液造模法属于正常免疫系统下的半抗原诱导性模型，当TNBS的乙醇溶液灌肠时，乙醇作为有机溶剂溶解肠粘膜表面的黏液，暂时性破坏肠粘膜屏障，使TNBS和肠组织蛋白结合形成完全抗原，导致肠黏膜免疫系统针对该抗原的迟发性变化反应，并造成肠黏膜的损伤。杯状细胞是黏蛋白的主要来源，其数量和形态反应肠粘膜的健康状况，是肠粘膜异常的敏感指标。由于斑马鱼通体透明的特点，有两种方法检测结肠炎的防治作用。1.观察肠腔面积的变化，2.通过特异性染料（呈蓝色）对肠道的杯状细胞染色，通过观察杯状细胞数量来判断肠粘膜的损伤情况。转基因NBT斑马鱼评价周围神经保护剂功效。药物不良反应检测方法
肠道消化是食物在消化道中分解的过程，包括机械性消化（通过消化道肌肉搜索将食物与消化液混合并向消化道远端推送）和化学性消化（通过消化腺分泌的消化酶将大分子分解为小分子物质的过程）。肠道内的消化液包括胰脂肪酶、胰蛋白酶、胰淀粉酶等。在受精后的26-126h，斑马鱼肠道的管腔形成，内胚层分化出连续的有功能的肠道上皮。斑马鱼肠道肌肉发达，可分为两层平滑肌，有利于食物的蠕动消化。通过特异性的检测试剂盒检测OD值，可以量化斑马鱼体内胰脂肪酶和胰蛋白酶含量。药物的有效性和安全性评价利用斑马鱼模型评价保护听力作用。
糖尿病是一种由遗传基因决定的与肥胖等环境因素促发有关的疾病，其基本病理生理为肯定或相对性胰岛素分泌不足引起的代谢紊乱。斑马鱼胰腺的形态发生和基本细胞结构、排列方式类似于哺乳动物，斑马鱼食欲调节（如血清素）和胰岛素调节功能与人类相似，斑马鱼其他涉及葡萄糖体内平衡的***系统（包括脑、肝、脂肪细胞组织和骨骼肌）的发育和功能也与哺乳动物类似。斑马鱼在糖负荷状态下表现出持续血糖高现象，用高糖高脂饲料可以诱发斑马鱼血糖高，模拟人的二型糖尿病。用血糖仪对高糖高脂斑马鱼进行血糖检测。
利用斑马鱼模型评价保护肾脏功效。肾脏是人体的重要组成部分,,发挥着从血液中滤过代谢废物并维持体内正常酸碱和渗透压平衡的重要作用。斑马鱼的肾脏与哺乳动物肾脏的发育及疾病的发生、发展存在很多相似之处，涉及的许多基因具有高度保守性。因此，斑马鱼适合用于评价保护肾脏功效。马兜铃酸主要损伤肾小管上皮细胞，导致肾间质纤维化及肾萎缩，并出现低分子蛋白尿、严重贫血症状，被称为“马兜铃酸肾病”。在人体和斑马鱼上，马兜铃酸均可诱发肾性水肿和肾脏形态功能异常，引起不可逆性肾损伤并至死亡。评价保护肾脏功效有两个指标：1.肾性水肿发生率。由于斑马鱼通体透明，肾性水肿可以明显的被观察到。2.肾小球滤过率。通过注射荧光物质，正常斑马鱼可将荧光物质排出体外，肾小球滤过功能损伤的斑马鱼不能将荧光物质排出体外。观察斑马鱼全身荧光强度可分析肾小球滤过率。利用斑马鱼模型评价骨质疏松症。
药物的临床疗效一般通过疗效观测指标来记录，而疗效评价可以是某一疗效观测指标的直接测量结果，更多的是在直接测量结果基础上转化而来的、特定的评价指标来评价。同一疗效观测指标，可以转化出多种疗效评价指标，不同的疗效评价指标在药物有效性确证中的作用不同和地位不同，有的可以作为主要疗效指标，有的则作为次要疗效指标。如某一适应证的评价量表，以前后的减分值为主要疗效指标，而以50%的减分率的患者比例为次要疗效指标。而另一适应证的评价量表，以积分变化到某一积分值以下患者的比例为主要疗效指标，而前后的减分值比较为次要疗效指标。斑马鱼模型评价眼毒性。体外药效试验
利用斑马鱼模型评价老年痴呆防治作用。药物不良反应检测方法
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