微生物菌种的改造是现代微生物发酵行业中,提高其工业化生产性能,提高酶和菌的性能非常重要的一个环节。而快速高效的高通量筛选方法的建立又是菌株改造中非常重要的一个环节。传统的微生物快速筛选方法,琼脂平板法可分为表型活性筛选和表型生长选择。表型活性筛选利用菌落周围产生的水解圈、颜色圈或荧光产物等进行酶活或目标产物筛选;表型生长选择根据细胞对或其他有害物质的抗性或营养缺陷型互补,在选择培养基中依据生长情况进行筛选。琼脂平板筛选法基于透明圈、颜色圈的琼脂平板活性筛选或基于营养缺陷型或抗性的琼脂平板生长选择可作为简单易行的初筛方法,用于排除大量无活性和极低活性的突变体。但并不是所有的改造目标都能建立琼脂平板筛选法。琼脂平板筛选法,是一种简单直接的筛选方法,已用于多种水解酶(如脂肪酶、酯酶、蛋白酶)和氧化还原酶(如漆酶)等突变库的初步筛选中。传统高通量筛选设备。北京菌株高通量筛选
离子通道是目前药物发现的重要靶点。例如在心血管疾病中,离子通道检测可以应用于原发性电障碍(长QT综合症、短QT综合症、Brugada综合症)等方面的药物筛选。以NovelKCNQ2channelactivatorsdiscoveredusingfluorescence-basedandautomatedpatch-clamp-basedhigh-throughputscreeningtechniques一文为例,通过一种改进的高通量筛选技术,筛选新型KCNQ2通道剂。在这篇文献中,作者团队以ZTZ240(KCNQ2通道剂)作为阳性对照,通过铊通量测定法从80000种化合物筛选出了565个比ZTZ240更强活性的化合物。然后使用384孔自动化膜片钳,进一步筛选出了38个KCNQ2通道剂。,使用传统的膜片钳表征剂,得到ZG1732和ZG2083(EC50分别为1.04μM和1.37μM)。北京菌株高通量筛选高内涵高通量筛选系统。
时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)原理为具有长寿命荧光(通常为100秒的毫秒至毫秒)的镧系配合物用作FRET供体,荧光蛋白或有机荧光团(例如,别藻蓝素或Cy5)用作受体。普通荧光的半衰期为纳秒级,镧系元素的半衰期为毫秒级,有6个数量级的差别。所以在检测时,TR-FRET有一个时间延迟~100微秒,从而使反应体系内普通背景荧光信号消耗掉,因此TR-FRET的背景信号非常低,能够反映样品实际情况。基于细胞水平的筛选的关键特征之一是可以一次筛选多个靶标。基于细胞的筛选常用于以下情况下:1)所需的分子靶标未知,2)靶标无法在生化测定中充分重组,3)所需的表型只存在于细胞环境中,例如从一种细胞类型分化到另一种细胞类型。基于细胞的检测贯穿于药物发现的所有阶段:靶标选择和验证、初步筛选、先导化合物识别、先导化合物优化以及安全和毒理学筛选。介绍一些细胞水平分析的方法:细胞活力、报告基因、第二信使和高内涵成像等。
从先导化合物的结构来看,特殊环系出现频次多的是嘌呤结构,这有可能与激酶和其他一些基于核苷酸的酶在很多疾病中起到的巨大作用有关。其他出现频次比较高的环系包括五元环的四氢噻唑、吡唑、吡咯、咪唑啉和吡咯烷,以及六元环哌啶和哌嗪类骨架。分子柔性增加:大部分的先导化合物都含有一个手性中心,更有6个化合物含有两个手性中心。从苗头化合物到先导化合物,Sp3杂化碳原子个数比例有着地升高,统计上来说从0.197± 0.157 上升到了0.255±0.162。高通量筛选技术原理。
高通量筛选是药物研发的一个重要手段,然而研究中发现一些化合物在不同类型靶点筛选中均表现出阳性结果,这类化合物称为“频繁命中化合物”(Frequent hitters)。根据筛选结果的有效性,频繁命中化合物可以大致分为两类,一是能与许多不同类型靶点成键结合的混乱化合物(Promiscuous compound);二是通过干扰实验条件而在多个实验中呈现出阳性结果的假阳性化合物(False positive)。虽然混乱化合物可能成为多药理作用的研究起点,但考虑其低选择性容易与其他蛋白发生反应从而导致潜在的毒副作用,因此这类化合物通常不作为新药物研发的优先;而假阳性化合物产生机制较为复杂,根据现有的研究主要可以分为:胶体聚集化合物、自荧光化合物、荧光酶抑制剂和化学易反应化合物。高通量筛选方法有哪些。湖南高通量筛选成本
高通量筛选的主要目的是什么。北京菌株高通量筛选
一种广泛应用的HTS技术是荧光各向异性(FA)/荧光偏振光(FP)。FA和FP方法实际上通过测量了染料所经历的旋转相关时间或翻滚时间的变化来表征分子量。在这些技术中,用偏振光激发荧光团,并用平行或垂直于入射光偏振的偏振器测量荧光发射。随着时间的推移,染料标记的分子下降,发射信号去极化。与大分子结合降低了荧光团的迁移率,从而增加了极化或各向异性,并允许定量结合。根据所涉及的质量,选择染料的寿命以比较大化结合后的信号变化。荧光素和罗丹明等有机染料的寿命约为3-4ns,它们在连接到分子量在0.5-10kDa范围内的生物分子时为敏感。北京菌株高通量筛选
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