微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关,并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺,调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层(mPFC)(关键的肠脑功能轴)的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。非靶标代谢组学预实验,周期短,报告快,专业可信耐。上海代谢组学数据分析
通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR北京微生物代谢组学研究方法代谢组学真正反映业已发生得变化。
非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。
微生物组和代谢组学结果表明,高比例的直链淀粉/支链淀粉比例能够调节消化和粘膜相关的盲肠微生物群落和代谢特征。三种比例中,喂养含有50%高直链淀粉的饮食具有更好的结果,因为其共生细菌(如Akkermansia,Lactobacillus和Faecalibacterium)的富集,戊酸盐的增加以及促炎细胞因子的减少。代谢组学结果显示盲肠组织的代谢特征发生了改变,包括脂质肉碱和α-生育酚等代谢物的上调和下调。这些发现为直链淀粉/支链淀粉的比例是如何通过调节微生物发酵,导致共生微生物群和代谢物的增殖,从而改善断奶山羊的盲肠环境提供了新的见解。本篇文章,检测了喂食不同直链淀粉/支链淀粉比例的山羊的盲肠中SCFAs和炎症因子的变化,并使用16s RNA测序检测了不同组山羊的盲肠粘膜和消化物中微生物的变化,找到了变化的优势菌群以及菌群和SCFAs的相关性。再使用LC-MS/MS非靶代谢组学研究了不同组山羊盲肠组织的代谢物变化。通过多组学结合的方式,揭示了不同比例的直链淀粉/支链淀粉对山羊盲肠环境的影响。欧易生物代谢组学专业分析检测技术**。
代谢组学研究:浓香白酒占中国白酒总产量的70%以上。自1960年代以来,在中国白酒酿造行业中,人工窖泥被***用于建造发酵窖以生产高质量的浓香白酒。为了深入了解人工窖泥原核生物分类和功能动力学机制,以及这种变化与生产高质量浓香白酒之间的联系,本文对该酿造微生态系统进行了***进行了16S rRNA测序,蛋白质组学和代谢组学联合分析。多组学方法能够更***地了解高质量浓香白酒生产过程中人工窖泥微生物群落发生的代谢过程变化,这将有助于进一步优化人工窖泥培养技术和改善浓香白酒的质量。欧易生物/鹿明生物提供专业的靶向代谢组学服务。上海代谢组学 轮廓分析
代谢组学生物解析 非靶代谢组学研究 靶向代谢组学研究。上海代谢组学数据分析
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:***通络***通过***和抗氧化作用预防及延缓糖尿病视网膜病变发展的机制研究研究对象:大鼠发表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影响因子:6.529发表时间:2022年2月合作单位:中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS+GC-MS双平台代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。文章通过对中药***—***通络方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在预防及***方面和微观层面均起到了***效果。同时,也探究出***通络方的内在作用机制。也为糖尿病视网膜病变的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS双平台代谢组学有助于对中药成分进行***的分析,为药物机制提供参考。上海代谢组学数据分析
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