土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。浙江靶标代谢组学
GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题:氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊:FrontiersinMicrobiology影响因子:5.64作者单位:上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品:iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。北京代谢组学一般多少钱欧易生物代谢组学专业分析检测技术**。
LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例,中文标题:使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象:年轻健康志愿者发表期刊:EnvironmentalPollution影响因子:8.071发表时间:2022年4月17日合作单位:中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术:LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征,并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。
LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响。标题:藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖(AOS)可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤,特别是细胞连接和微绒毛;并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能,提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响,并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性,发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响,其中大部分是在小肠功能中起着重要作用的脂质代谢物,表明FMT可以在血液中恢复被白消安扰乱的代谢物。相关性分析表明,“有益菌”乳酸杆菌有助于血液代谢产物的恢复,“有害菌群”则不能协助血液代谢物的回收,揭示了FMT可改善小肠功能和肠道菌群,恢复血液代谢的原因。代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。代谢组学数据分析教程 代谢组学一般测几个样。浙江代谢组学定量方法
非靶向代谢组学,靶向代谢组学研究经验。浙江靶标代谢组学
LC-MS和GC-MS两大平台是现今代谢组学研究**常用的两大技术平台,各自有其特点和优势,在物质检测的范围和种类上,都有一定的偏向性。往往一种方法、一个技术平台很难获取样品当中***的代谢物信息,为了解决这个问题,LC-MS+GC-MS这种组合式双平台解决方案,可以**提升代谢组学检测的覆盖度,获取更加***的代谢物及其丰度信息,鹿明生物运用此研究策略,已协助更多客户更好的达成了科研目标。鹿明生物、欧易生物双平台代谢组学可***研究代谢物的信息,为您的科学研究助力。浙江靶标代谢组学
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