西安烈冰生物空间转录组测序服务

10XVisium的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息。具体实验流程如下：A、切片制备和优化：取新鲜组织、冷冻、切片，并进行HE染色成像，优化确定切片是否覆盖靶向区域。B、切片固定和透化：将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上，并进行固定和透化，使细胞中的mRNA得到释放，并结合到相应的捕获探针上，从而获取基因表达信息。C、逆转和文库构建：以捕获的RNA为模板，进行cDNA合成，和测序文库制备。D、高通量上机测序：对制备好的测序文库，进行二代高通量短读长测序。E、数据可视化分析：结合HE结果，确定哪些基因有表达，表达量高低，以及这些基因的空间位置信息空间转录组测序数据分析，认准烈冰NovelBrain生物信息数据分析平台。西安烈冰生物空间转录组测序服务

10XGenomics和Drop-Seq的技术原理。是利用十字交叉的通道，从横向孔道中逐一输入凝胶微珠，纵向孔道输入细胞，凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上，并通过微流控技术，将之输入到油相孔道中。这时候，就形成了一个个油滴后输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠，那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库，进而完成细胞中RNA的捕获过程。无锡烈冰空间转录组数据分析烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。

多样本数据合并：FractionofReadsKept：合并样本时，各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深入解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！

空间转录组数据可以用单细胞转录组数据的分析策略进行分析，例如，利用GO和Pathway分析筛选不同发育时期特定空间区域内的信号通路及其关键基因的较大情况，揭示在特定发育时期特定区域内发生的生物学过程。针对任何一个基因，空间转录组可以显示表达该基因的点阵及其空间排布；单细胞转录组可以给出该基因表达的细胞类群；原位测序可以给出该基因在细胞内的表达状况。通过不同发育时间点的信息比较，可以分析细胞类群在某个部位在不同时间点的差异，给出其在细胞内的真实的演变状况。测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学重要问题。

作为2019年的明星技术之一，10x Genomics单细胞测序凭借其高通量、低成本、易操作、稳定性高等优势一直保持着高热度，目前利用该平台发表的文章已达500多篇。空间转录组技术优势：实现基因表达数据与空间定位信息的结合，解析多种类型组织切片样本中基因表达谱；无需组织解离，保留组织结构及细胞微环境，鉴定异质性组织中细胞类型，避免相关偏好性；可用于挖掘新的组织生物标记物；可与现行实验室组织分析方法轻松对接，短时间内即可完成切片及文库制备流程。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用，是下一个改变世界的技术。无锡上海烈冰生物空间转录组测序

十二年测序经验，烈冰生物空间转录组领域的佼佼者。西安烈冰生物空间转录组测序服务

在转录组学领域，空间转录组也开辟了新世界。Nature Methods在今年1月份将空间转录组学评价为2020年度方法，空间转录组方法近几年越来越受到欢迎，它将带领组学在生物学的研究上进入新的阶段。从转录组测序到实现单细胞转录测序，这一过程为精确认识不同细胞类型提供了巨大的帮助。现在，新的空间转录组方法不仅带来转录组信息，同时还提供空间信息，帮研究者更好辨别转录的位置，进一步扩展到单细胞分辨率，这会更大程度提升科学家对单个细胞的认识和解读。西安烈冰生物空间转录组测序服务

上海烈冰生物医药科技有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标，有组织有体系的公司，坚持于带领员工在未来的道路上大放光明，携手共画蓝图，在上海市等地区的医药健康行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源，也收获了良好的用户口碑，为公司的发展奠定的良好的行业基础，也希望未来公司能成为*****，努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量，我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息，斗志昂扬的的企业精神将**上海烈冰生物医药科技供应和您一起携手步入辉煌，共创佳绩，一直以来，公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针，员工精诚努力，协同奋取，以品质、服务来赢得市场，我们一直在路上！