企业商机
空间转录组基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研(临床)检测服务
空间转录组企业商机

空间组测序技术,作为现阶段单细胞技术的重要补充技术进入了组学的实验领域以及生物信息学的分析领域。通过单细胞测序(单细胞表达尺度)+空间转录组测序(空间表达尺度)+数字病理(临床诊断尺度)联合分析可在空间和时间上描述不断演变的组织生态系统,多角度深入分析组织的形态特征、基因组学特征、表观遗传调控因子以及样本中的免疫微环境。不同于单细胞测序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空间转录组分析实际上是非常需要研究者和企业之间的互动的,尤其是对于组织切片的理解,一个在线互相交流空间转录组测序结果的系统也是空转分析中不可或缺的一环,也是重中之重。烈冰科技成立10余年,为科研学者提供专注的测序数据分析服务。成都烈冰空间转录组测序

机体为响应各种应激,其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”;当细胞在不同状态之间转变时,往往会经历转录重组,导致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“唤醒”,但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的;scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析,即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况,构建细胞谱系发育,但这里的时间并不是真时间,而是一个虚拟的时间,是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中,也会存在多种不同的细胞形态。因此,不论测定了多少样本,我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。济南上海烈冰生物空间转录组测序服务公司十二年测序经验,烈冰生物空间转录组领域的佼佼者。

空间转录组研究的的必耍性:研究单细胞是想要探究细胞间的异质性,但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液,然后利用单细胞分离技术(微孔,微板,液滴)等方法实现单细胞建库,这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中是非常重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要,因此发展空问转录组技术实现细胞的位置信息的保留,对研究此类细胞状态尤为必要。

作为2019年的明星技术之一,10x Genomics单细胞测序凭借其高通量、低成本、易操作、稳定性高等优势一直保持着高热度,目前利用该平台发表的文章已达500多篇。空间转录组技术优势:实现基因表达数据与空间定位信息的结合,解析多种类型组织切片样本中基因表达谱;无需组织解离,保留组织结构及细胞微环境,鉴定异质性组织中细胞类型,避免相关偏好性;可用于挖掘新的组织生物标记物;可与现行实验室组织分析方法轻松对接,短时间内即可完成切片及文库制备流程。烈冰引进国际主流空间转录组测序平台,提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的科学突破。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。十二年测序经验,累计服务与5000余项重要科研项目。无锡烈冰空间转录组平台

空间转录组测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。成都烈冰空间转录组测序

当前的技术主要有四种策略:1、基于组学实验结合空间重建的计算策略这种计算方法可以充分利用内在基因表达模式或共表达的趋势,从单个细胞的大量转录组数据中重构细胞间的环境。然而,这些推论方法在某些情况下只呈现空间趋势或特定组织的总体布局。2激光切割与NGS测序结合的策略基于LCM的转录组学或基因组学成功地获得了单个细胞的空间转录组,尽管其通量很低,但是在可以标记成千上万个单个细胞位買的多路复用条形码策路可行之前,将少量细胞的数据粗略地整合到构成组织的巨大背景中,可能具有一定价值。3、基于荧光物质原位的转录组学基于图像的原位转录组学在很大程度上增加了可检测区域,但也存在一些问题,例如几种smFISH方法很难从包括信号干扰、转录本积累等复杂背景中提取单个细胞。4、基于身核苷酸的空间条码加上NGS测序。成都烈冰空间转录组测序

上海烈冰生物医药科技有限公司主要经营范围是医药健康,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务分为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于医药健康行业的发展。烈冰生物立足于全国市场,依托强大的研发实力,融合前沿的技术理念,及时响应客户的需求。

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