企业商机
空间转录组基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研(临床)检测服务
空间转录组企业商机

已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大,或是存在有效测序深度不足等问题。10xGenomics公司提供的Visium空间基因表达解决方案是目前一个高通量空间转录组的商业化解决方案。该解决方案可以轻松地将空间转录组学技术应用到组织切片和染色的标准方法中,从而研究空间分辨率下整个转录组mRNA的表达情况,同时在同一组织切片中获得组织学相关信息。空间转录组可展示组织切片中不同区域的基因表达情况,揭示精细病理区域的信号通路。苏州烈冰生物空间转录组测序服务

细胞在组织样本中的相对空间位置关系对于了解疾病病理学非常重要。但是scRNA-Seq在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构,无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题,通过记录组织切片细胞的空间信息,捕获组织切片中的组织学信息;通过免疫荧光进行蛋白组检测,将基因表达谱映射回组织样本中的原始位置,同时获得细胞/基因的空间表达特异性。该技术可以为神经科学,发育生物学,免疫生理学等领域的研究提供组织和基因表达情况的新视角。成都烈冰科技空间转录组技术支持烈冰专精空间转录组测序领域。

在转录组学领域,空间转录组也开辟了新世界。Nature Methods在今年1月份将空间转录组学评价为2020年度方法,空间转录组方法近几年越来越受到欢迎,它将带领组学在生物学的研究上进入新的阶段。从转录组测序到实现单细胞转录测序,这一过程为精确认识不同细胞类型提供了巨大的帮助。现在,新的空间转录组方法不仅带来转录组信息,同时还提供空间信息,帮研究者更好辨别转录的位置,进一步扩展到单细胞分辨率,这会更大程度提升科学家对单个细胞的认识和解读。

烈冰生物生信分析团队紧追国际前沿、整合添加多项国际期刊认可的空转分析工具,构建一套完整的数据分析流程;精心研发空转结果浏览器,可同步展示空间转录组与单细胞测序分析结果,详细深入地解析空间转录组数据。完成从Rawdata(原始数据)到Spot-Gene的具有定位信息的表达矩阵的过程后,就进入了空转的第二步,去进行Spot的Cluster的过程,熟悉单细胞测序的研究者知道,Cluster在单细胞测序中往往表示为细胞的类型,也就是说能聚在一起采用算法分为一个群体细胞是一个Celltype(当然分情况也会有不同)。而在空转中,也正是由于前面提到了细胞的非单一性,导致了这里的分群并不是单纯的同一细胞类型,而应该认为是具有相同细胞组成的点阵区域,或者说是近似的组织结构区域。自主研发PanoCell单细胞实验测序平台。

10XGenomics和Drop-Seq的技术原理。是利用十字交叉的通道,从横向孔道中逐一输入凝胶微珠,纵向孔道输入细胞,凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上,并通过微流控技术,将之输入到油相孔道中。这时候,就形成了一个个油滴后输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠,那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库,进而完成细胞中RNA的捕获过程。从样本处理到终端数据分析,只要您需要,烈冰提供全流程的无忧服务。成都烈冰科技空间转录组技术支持

助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力生命健康医疗大时代!苏州烈冰生物空间转录组测序服务

空间组测序技术,作为现阶段单细胞技术的重要补充技术进入了组学的实验领域以及生物信息学的分析领域。通过单细胞测序(单细胞表达尺度)+空间转录组测序(空间表达尺度)+数字病理(临床诊断尺度)联合分析可在空间和时间上描述不断演变的组织生态系统,多角度深入分析组织的形态特征、基因组学特征、表观遗传调控因子以及样本中的免疫微环境。不同于单细胞测序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空间转录组分析实际上是非常需要研究者和企业之间的互动的,尤其是对于组织切片的理解,一个在线互相交流空间转录组测序结果的系统也是空转分析中不可或缺的一环,也是重中之重。苏州烈冰生物空间转录组测序服务

上海烈冰生物医药科技有限公司一直专注于生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】,是一家医药健康的企业,拥有自己**的技术体系。公司目前拥有专业的技术员工,为员工提供广阔的发展平台与成长空间,为客户提供高质的产品服务,深受员工与客户好评。上海烈冰生物医药科技有限公司主营业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。公司深耕单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,正积蓄着更大的能量,向更广阔的空间、更宽泛的领域拓展。

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