酵母双杂交(Y2H):植物转录因子(Plant transcripter factors, TFs)是调控植物生长发育和环境适应性的关键分子。虽然在一些数据库中,如RiceSRTFDB (Priya and Jain, 2013), Ricettissuetfdb (Chen et al.,PlnTFDB (Pérez-Rodríguez et al., 2009)和PlantTFDB (Jin et al., 2017),可以预测水稻转录因子功能。但通过具体实验研究,来直接证实转录因子对植物的调控作用仍然是必不可少的。酵母双杂交(Y2H)和酵母单杂交(Y1H)是被用于研究蛋白-蛋白以及蛋白-DNA互作的**常用技术。为了方便和促进水稻育种研究,陈凡老师与欧易生物达成合作,整合双方优势资源,历经春秋与冬夏,成功构建了基于粳稻(日本晴)基因组的水稻转录因子文库。该项成果以“一种高效的筛选系统来鉴定大米转录因子的蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA相互作用伙伴”为题,发表于杂志JGG上。酵母及其应用ppt课件 酵母及其应用 。湖北生物技术酵母文库做什么
酵母文库:细菌鞭毛蛋白是一种重要的细菌毒力因子,可刺激动植物细胞中的分子免疫信号转导。脊椎动物识别鞭毛蛋白和建立有效免疫反应的详细机制已经被揭示;然而,无脊椎动物是否能够识别鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山东大学王显伟团队在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上发表了题为“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究论文,揭示了MjShoc2可以与鞭毛蛋白FlaA互作,引发一系列炎症反应,促使对虾抵抗细菌***,为无脊椎动物对鞭毛蛋白的感知机制提供了见解。该项目中所用的对虾酵母文库由欧易生物构建。浙江发展酵母文库为在校期间为实验室构建3个高效的水稻酵母双杂交文库。
酵母双杂交文库:植物从营养生长到生殖生长时相的不可逆转变,是植物生命周期中的一个关键阶段,是植物生存和繁殖至为关键的重要事件。在开始繁殖之前,许多多年生木本植物经历了一个相当漫长的幼年时期。与模式植物(如拟南芥)相比,针叶树通常具有非常长的生命周期。尽管在模式植物开花时间控制研究上取得相当大的进展,但对多年生树木,特别是针叶树年龄信号的调控机制仍知之甚少。因此,深入研究林木年龄信号对生殖发育过程的影响具有重要的理论和实践意义。
酵母单杂交结果显示,磷酸盐饥饿响应因子OsPHR1/2/3可以***51个目标启动子中的25个,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以调控许多菌根共生相关基因的表达(图A)。对丛枝菌根共生响应基因启动子序列预测分析显示,有78个转录因子被富集,87%的菌根共生响应基因受到OsPHR1/2/3的调控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接调控。因此推测OsPHR1/2/3可能是菌根共生调控网络中的一个关键调控枢纽(图A-B)。EMSA和荧光素酶报告实验证实,OsPHR12可以直接结合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3启动子序列(图C-F),并且这种结合依赖于启动子中的P1BS元件(图G)。酵母文库酵母单杂交筛库科技研究双文库高校外包平台。
进行了酵母双杂交文库的筛选,结果显示钙依赖的种子特异性蛋白激酶SPK可以与OsNF-YB9相互作用,分段截取互作验证显示OsNF-YB9的N端是互作所必须的(图a-b),并通过双荧光分子互补实验、BiFC、体外GST-pulldown实验得以证实(图c-e)。亚细胞定位显示SPK主要在细胞质中表达,OsNF-YB9在细胞质和细胞核中都有表达,共表达SPK和OsNF-YB9***促进了OsNF-YB9的入核(图f),表明SPK和OsNF-YB9的相互作用可能促进了OsNF-YB9从细胞质向细胞核的运输。RT-PCR显示SPK在发育中的种子中高表达,在5DAF开始***,并在10-30DAF维持高表达水平(图a-b)。spk敲除突变体种子中垩白率的增加(图c-e),但粒形和粒重与野生型没有***差别。不懂就问,酵母文库实验室究竟长啥样?拥有十余年丰富的文库构建。陕西品质酵母文库
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进行了酵母双杂交筛选实验,结果显示 MdMPK3 可以与 MdWRKY17 相互作用(图 C),并且通过 BiFC、Co-IP 得以证实(图 D-E)。MdMPK3 的激酶活性水平在炭疽菌***后也***上升(图 B)。进一步的 BiFC 和 Co-IP 表明,MdMEK4 可以与 MdMPK3 相互作用(图 F-G)。体外激酶试验表明,MdWRKY17 能够被MdMEK4- MdMPK3 级联磷酸化(图 H)。综上,MdMEK4-MdMPK3 级联磷酸化 MdWRKY17。与对照相比,MdWRKY17过表达植株中水杨酸含量降低,而RNAiMdWRKY17植株中水杨酸含量升高(图A)。湖北生物技术酵母文库做什么
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