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酵母文库基本参数
  • 品牌
  • 欧易生物
  • 公司名称
  • 上海欧易生物医学科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物测序服务
  • 安全质量检测类型
  • 基因测序
  • 服务内容
  • 酵母文库
  • 所在地
  • 北京,上海,广州,深圳,成都,杭州,天津,南京,武汉
  • 检测类型
  • 基因测序
酵母文库企业商机

通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。酵母文库酵母双杂交筛库个性化定制研究方案。欧易生物酵母文库使用

酵母双杂交文库:本研究通过蓝/红光诱导青蒿中青蒿素生物合成基因的表达,使用转录组分析确定了一个WRKY转录因子AaWRKY9,可明显***青蒿素生物合成相关基因的表达。实验表明AaWRKY9通过光依赖JA信号通路调节,在青蒿素生物合成中发挥重要作用,AaWRKY9通过与AaDBR2和AaGSW1的启动子结合正向调节青蒿素的积累。此外,JA信号通路中的抑制因子AaJAZ9与AaWRKY9相互作用,并抑制其转录***活性,而在MeJA存在情况下,AaJAZ9被降解,AaWRKY9的转录***活性增加,进而促进青蒿素生物合成基因的表达。酵母双杂交文库结果表明,AaWRKY9有助于光和JA信号调节青蒿素的生物合成,为两种信号途径在植物次生代谢物合成中的整合调控提供了新见解。安徽宣传酵母文库smart酵母建库和gateway酵母建库,满足各类客户的需求。

酵母双杂交、GSTpull-down实验显示,SWC6可以直接与HY5、HYH相互作用(图A-C)。pull-down实验显示ARP6同样可以与HY5、HYH相互作用(图D)。split-LUC、Co-IP实验证实HY5可以与SWC6、ARP6结合(图E-J)。下胚轴表型分析显示,蓝光下arp6hy5hyh三突变体下胚轴长度明显大于arp6突变体、hy5hyh双突变体,表明ARP6和HY5有可能通过不同途径调控下胚轴的发育。Semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验显示,蓝光下,在 CRY1 存在下,SWC6 与 ARP6 的结合***增强。表明蓝光***的 CRY1 可能通过蓝光依赖的 CRY1-SWC6/ARP6 相互作用增强 SWC6 与 ARP6 的结合。

本研究利用水稻转录因子文库筛选,绘制了水稻转录因子和菌根共生相关基因之间的调控网络。该网络受到保守的磷感应途径统一控制,以磷酸盐饥饿响应因子(PHR)为中心。PHRs 是菌根共生所必需的,通过 P1BS 顺式作用元件调控菌根共生相关基因表达。高磷条件下,SPX蛋白抑制 OsPHR2 介导的对菌根共生相关基因表达的调控,进而抑制菌根共生。过表达 OsPHR2 可以部分拮抗磷介导的对菌根共生的抑制作用。本研究发现,植物直接营养吸收和通过菌根共生的间接营养吸收,都受到相同的磷信号网络统一调控。本研究将有助于高效用磷植株的培育。酵母生长速度快且容易操作的特点酵母文库。

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