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空间代谢组学基本参数
  • 品牌
  • 欧易生物
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  • 上海欧易生物科技有限公司
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  • 产品检测,科研服务,技术研究
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空间代谢组学企业商机

空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病的发生。中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠空间代谢组产品齐全,价格低,高效专业。四川空间代谢组学 药效物质

队列1:收集手术切除的食管腺*(EA)组织和与之匹配的健康食管上皮组织(MHEE)。队列2:收集健康食管上皮组织(来自健康志愿者,HEE)和未经***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活检样本,用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化,以及队列1的外部验证。样本制备:样本制成冰冻组织切片,并结合H&E染色。研究方法:空间代谢组学;qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达;细胞转染沉默ACYL基因;免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。湖北空间代谢组学是三维还是二维专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。

作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA,发现MYC**中不饱和脂肪酸(FA(18:1))的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢,而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时,细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。

空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法。

空间代谢组学(AFADESI-MSI):中文标题:使用敞开式质谱成像技术及代谢组学绘制大鼠脑代谢网络图研究对象:大鼠脑发表期刊:AnalyticalChemistry影响因子:6.986发表时间:2021年4月23日研究单位:中国医学科学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室运用生物技术:空间代谢组学(AFADESI-MSI)。大脑是结构**复杂的***之一,主要功能与其微区的分子相互作用密切相关。大脑的小分子调节机制对理解***功能、精神疾病机理和药物研发有很大的帮助。动物的认知过程和行为控制均依赖于脑部强大的***网络——神经连接体。科学家进行了很多研究,但是对脑部小分子网络的研究仍有不足。质谱成像技术可以实现生物上千代谢物的定性。上海空间代谢组学质谱

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AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法,能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来,从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术,灵敏度可达到 pg 级,且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级,实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别,可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。四川空间代谢组学 药效物质

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