本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称为结直肠异常)与正常健康个体。鹿明生物空间代谢组学。湖南质谱成像空间代谢组学
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病的发生。中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠辽宁空间代谢组学基本研究流程空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。
空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型,本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析;(样本策略)选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析,并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来,采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现,调查该技术在小样本上的表现,并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组学-代谢组学服务-擅长多组学联合分析。
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学空间代谢组突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈。青海空间代谢组学 代谢流
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基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。相关研究成果发表在Gut、PNAS、APSB、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上。目前鹿明生物已建立了特定组织专属的空间代谢组数据库鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~湖南质谱成像空间代谢组学
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