通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。进口试剂高服务质量市场份额大酵母文库。湖北实力酵母文库报价
酵母双杂交文库:为研究松树生长时相转变和生殖发育的奥秘,本研究收集了油松 7 个年龄段的叶片进行了转录组测序。加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定到一个与年龄***相关的基因模块(图 A)。按照表达模式,可以分为 2 个子模块:随年龄增长而表达上升的基因子模块、随年龄增长而表达降低的基因子模块(图 B-D)。这些基因在 5-7 年营养生长至生殖生长过渡期发生了一个明显的表达模式转变,表明在生殖发育启动阶段存在一个相对剧烈的时相转变过程。山东酵母文库规格酵母单杂交文库筛选选欧易生物技术可靠服务高效。
酵母双杂交表明拟南芥AtBT2蛋白可以与AtRGA互作。与对照相比,拟南芥bt1/2双突变体幼苗高度降低,而硝酸盐处理可以进一步抑制其生长,外源施加GA可以回复其生长缺陷。在拟南芥中异源表达MdBT2可以明显提高植株高度,而PAC处理则会抑制这种生长的促进作用。在拟南芥中异源表达MdRGL3a可以明显抑制植株生长,而硝酸盐处理和MdBT2过表达则会缓解这种生长抑制作用。外源GA处理可以逆转以上对植株生长的影响(图A-D)。以上结果表明,BT蛋白通过DELLA蛋白调控植株生长,这一机制在不同的植物中具有保守性。
酵母双杂交、pulldown和BiFC实验均显示,MdTRB1可以通过其C末端与JAZ1蛋白互作。在苹果叶片和愈伤组织中过表达MdJAZ1,花青素和原花青素的累积受到明显抑制。在苹果叶片和愈伤组织***表达MdJAZ1/MdJAZ1,结果显示过表达MdJAZ1抑制了MdTRB1对花青素和原花青素累积的促进作用。Pull down 实验和荧光素酶互补成像实验结果表明,在 MdJAZ1 存在下,MdTRB1 与 MdMYB9 的结合减弱(图 a-c);外源施加 JA 可以部分恢复 MdTRB1 与 MdMYB9 的结合。对于 MdTRB1 在 JA 介导的花青素和原花青素积累中的作用机制,本研究建立了一个新的模型:MdTRB1 通过与 MdMYB9 互作,增强了 MdMYB9 对下游基因的转录***活性,进而正向调节了 JA 介导的花青素和原花青素累积。在 JA 缺乏的条件下,MdJAZ1 与 MdTRB1 互作,干扰了 MdTRB1 与 MdMYB9 之间的结合;在 JA 存在的条件下,MdJAZ1 被降解,MdTRB1 被释放出来以参与后续过程。酵母文库已知蛋白互作灵活定制建库。
通过酵母双杂交文库进行了互作蛋白的筛选,结果显示TaTIFY9可以与TaSRL1相互作用(下图A),并通过Bi-FC、荧光互补实验得以证实(图B-C)。TaTIFY9属于茉莉酸信号途径关键因子JAZ家族的成员之一。RT-PCR显示TaTIFY9也主要表达于小麦根部,外源施加茉莉酸可以***诱导TaTIFY9表达。这一结果表明,TaSRL1可能通过与TIFY9结合介导了茉莉酸对根生长的抑制。已有研究表明 ERF 蛋白可以特异性结合到靶基因启动子序列中的 GCC-box 序列。TaSRL1 属于 ERF 家族。在生长素转运基因 TaPIN2 的启动子序列中含有一个 GCC-box 序列。酵母单杂交实验显示,TaSRL1 可以直接与 TaPIN2 启动子结合并***其表达(图 A),但该***作用会被TaSRL1的互作蛋白TaTIFY9 所抑制(图 B和C)。一个专属自己的酵母文库才是正确的打开方式。湖北实力酵母文库报价
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酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。湖北实力酵母文库报价
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