南京scRNA单细胞多组学测序

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。BD Scanner，是您实验过程的又一双眼睛，实时监测，精细质控。南京scRNA单细胞多组学测序

科研的魅力之处，在于无穷尽的探寻生命的本底，通过单细胞测序，我们对组织的分子基础的研究也从初级到深层，并在单细胞层面逐渐达成一致，那么不禁要问一句，组织的空间位置到底重不重要？空间异质性是功能的关键特征，细胞的位置信息更能反应细胞命运调控机制和细胞谱系发生过程。因此时间和空间即像组织的AB面，而不可否认的是，此时空间坐标的记录，像一个还未长大的娃娃，虽未触及分子基础研究的深层，但仍在努力攀登探寻生命本底的下一个高峰。西安单细胞测序单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病发展提供了强有力的工具。

单细胞测序庞大的数据烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，可实现零代码操作、简单方便：单细胞浏览器的操作简单，不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行，即使生信0基础用户也可以运用自如；可视化展示海量结果文件：可视化展示Cluster的基因数，UMI数量、线粒体RNA占比信息；以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等；3D立体展示，文章动图先人一步：单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示，更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。

烈冰生物在上海、北京、广州、西安、江西等多地部署单细胞测序实验组中心，多地部署搭建BD Rhapsody单细胞实验平台，基于微孔的强大的高通量单细胞分析系统，为您提供可靠的单细胞分析工作流程，该系统可通过简单的唯恐把工作流程和多重条码标记系统，对高通量单细胞进行多组学的信息捕获，由此捕获的信息科进一步生成各种类型的二代测序（NGS）文库。之后对文库进行测序和基于NovelBrain生物大数据分析平台（云平台）的数据可视化分析，实现高位分辨率下的组织内基因的表达差异和表达丰度。截至2022年6月，烈冰助力发表单细胞测序文章30+篇。

基因和基因产物并不是单独运作的，而是参与了相互关联的复杂通路、网络和分子系统，这些合在一起实现了细胞、组织和生物体的运作。定义这些系统并确定它们的特征和相互作用，对于了解生物系统如何运作至关重要。”为了推动科学发现，科学家们需要各种能够帮助多方位了解其样本的潜在生物复杂性的研究工具。对于越来越多的研究人员来说，单细胞RNA测序和单细胞多组学——即在单细胞分辨率下对基因表达及其他基于DNA、RNA或蛋白质的分析物进行定量分析的基因组方法——在帮助解决他们面临的生物学问题上已证实是行之有效的。单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。深圳single cell 单细胞测序

BD Rhapsody平台在细胞捕获过程中没有偏好性，可同样无差别捕获中性粒细胞。南京scRNA单细胞多组学测序

烈冰生物BD Rhapsody平台，采用精简的工作流程助力您的实验成功： 1.制备单细胞悬液：可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶联抗体( Ab-Oligos)将细胞染色 2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换 3.单细胞捕获工作流程: (1)细胞上样:上样 575微升细胞悬液；系统未采用微流体通道设计，无需担心通道堵寨；通过重力轻轻沉淀细胞，可捕获脆弱细胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000个分区，可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞 (2)细胞上样扫描：估算捕获的活细胞数量和细胞多态率 (3)磁珠上样：微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描：估算包含活细胞和磁珠的微孔数量；测定细胞存留率，评估是否发生细胞损失 (5)细胞裂解：使用裂解缓冲液，确保细胞完全裂解 (6)磁珠回收：轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况南京scRNA单细胞多组学测序

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