烈冰生物单细胞数据分析可视化

机体为响应各种应激，其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”；当细胞在不同状态之间转变时，往往会经历转录重组，导致一些基因被沉默，一些基因被重新“唤醒”，但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的；scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析，即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况，构建细胞谱系发育，但这里的时间并不是真时间，而是一个虚拟的时间，是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中，也会存在多种不同的细胞形态。因此，不论测定了多少样本，我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。ATCG碱基的排列组合构成了测序的庞大世界。烈冰生物单细胞数据分析可视化

多样本数据合并：Fraction of Reads Kept：合并样本时，各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！BD Rhapsody单细胞测序服务单细胞测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系，一度成为高通量测序技术的“天花板”。

烈冰生物单细胞测序服务体系，不仅提供10X Genomics和BD Rhapsody两大国际认可的单细胞实验平台，在“附加”产品上，我们提供BD FACS Melody流式细胞仪，满足您对特殊细胞类型的富集需求，自主研发的Panocell单细胞捕获芯片，可兼容BD 平台全套原装磁珠、试剂和protocol,为您提供完整的单细胞多组学解决方案。从细胞多样本分析和染色所需的试剂到检测试剂盒，生物信息分析工具，和在线大数据分析系统、精简方案和专业团队技术支持，烈冰生物可为您提供用于单细胞多组学甚至到空间转录组测序的各种工具，助您加速科研探索之旅。

细胞计数和活力评估在评估样本质量时，需要在细胞清洗和过滤之后测定细胞活力，这一点至关重要。测定细胞活力有许多种方法，烈冰多年单细胞测序经验发现台盼蓝法在鉴定活细胞与死细胞的比例时效果很好。细胞计数的准确性以及目标回收量和实际回收量之间的一致性，取决于我们了解样本中有多少个细胞。一旦过滤和清洗完成，可采用细胞计数设备（如血球计数器或自动细胞计数仪）进行定量。这些设备不但能提供准确的细胞计数，还能计算出向微流体芯片上样适量细胞所需的细胞悬液体积。测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。

BD Rhapsody单细胞转录组测序是利用单细胞水平上的高通量测序分析基因表达谱的技术，突破传统高通量测序的局限性，针对多种组织类型的样本，采用BD 细胞悬液制备protocol组织解离后，单个样本一次上机能捕获500-10000个细胞， 基于每个细胞分别建库测序，获得单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型，可以在不同样本间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较，反映细胞间的异质性，提供足够灵活的定制测定法以满足多种实验需要，并有效缩短实验是时间和降低测序成本。烈冰专注单细胞多组学测序领域。北京单细胞平台

2019年，烈冰已助力发表了采用BD Rahpsody平台的单细胞风湿类文章。烈冰生物单细胞数据分析可视化

基因和基因产物并不是单独运作的，而是参与了相互关联的复杂通路、网络和分子系统，这些合在一起实现了细胞、组织和生物体的运作。定义这些系统并确定它们的特征和相互作用，对于了解生物系统如何运作至关重要。”为了推动科学发现，科学家们需要各种能够帮助多方位了解其样本的潜在生物复杂性的研究工具。对于越来越多的研究人员来说，单细胞RNA测序和单细胞多组学——即在单细胞分辨率下对基因表达及其他基于DNA、RNA或蛋白质的分析物进行定量分析的基因组方法——在帮助解决他们面临的生物学问题上已证实是行之有效的。烈冰生物单细胞数据分析可视化

上海烈冰生物医药科技有限公司是一家生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询，市场营销策划，市场信息咨询与调查（不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验），从事货物及技术的进出口业务，计算机、软件及耗材（除专控），软件开发【依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司，是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。烈冰生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队，以高度的专注和执着为客户提供单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序。烈冰生物不断开拓创新，追求出色，以技术为先导，以产品为平台，以应用为重点，以服务为保证，不断为客户创造更高价值，提供更优服务。烈冰生物始终关注医药健康市场，以敏锐的市场洞察力，实现与客户的成长共赢。