酵母单杂交筛选技术:关于HIV想必大家都不陌生,***HIV病毒后潜伏周期长,且目前没有完全的***方法。为了彻底***HIV,不让其发病就要从2方面入手:要么消除潜伏***的细胞,要么防止潜伏原病毒的细胞被***。也就是需要抑制HIV病毒的转录。但是关于HIV在人细胞中的复制、转录和潜伏期调控的分子网络仍不完全确定,所以目前HIV仍不能被**。为了帮助解决这个问题,波士顿大学的研究者,使用酵母单杂交筛选技术,以HIV-1,HIV-2的LTR(启动子和增强子)为诱饵,筛选了人的转录因子文库(包含1086个人的转录因子),**终绘制了调节HIV-1和HIV-2的转录网络图谱,结果发表在2021年的PNAS杂志上。酵母文库质粒使用指南酵母菌的介绍 。黑龙江运用酵母文库
酵母文库:细菌鞭毛蛋白是一种重要的细菌毒力因子,可刺激动植物细胞中的分子免疫信号转导。脊椎动物识别鞭毛蛋白和建立有效免疫反应的详细机制已经被揭示;然而,无脊椎动物是否能够识别鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山东大学王显伟团队在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上发表了题为“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究论文,揭示了MjShoc2可以与鞭毛蛋白FlaA互作,引发一系列炎症反应,促使对虾抵抗细菌***,为无脊椎动物对鞭毛蛋白的感知机制提供了见解。该项目中所用的对虾酵母文库由欧易生物构建。黑龙江运用酵母文库酵母文库酵母双杂交筛库个性化定制研究方案。
通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。
通过酵母双杂筛选实验,进一步研究AaWRKY9蛋白功能,结果筛选到了与AaWRKY9互作的AaJAZ9蛋白,并通过Y2H、BiFC、CoIP等进行了验证确认。JAZs是JA介导的植物相应中的负向调控因子,在毛状体和老叶中高表达,在芽尖和嫩叶中表达量低。为确认AaJAZ9是否抑制了AaWRKY9在促进青蒿素积累过程中的转录***功能,通过双荧光素酶报告基因检测实验发现,当AaWRKY9与AaJAZ9共表达时,其转录活性被抑制,而使用MeJA处理后,这种抑制作用被抵消,且AaWRKY9转录活性增强,反向验证实验结果一致。说明JA可以通过降解JAZ9,提高AaWRKY9转录活性,促进青蒿素生物合成。酵母文库文库构建筛选欧易生物。
酵母单杂交结果显示,磷酸盐饥饿响应因子OsPHR1/2/3可以***51个目标启动子中的25个,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以调控许多菌根共生相关基因的表达(图A)。对丛枝菌根共生响应基因启动子序列预测分析显示,有78个转录因子被富集,87%的菌根共生响应基因受到OsPHR1/2/3的调控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接调控。因此推测OsPHR1/2/3可能是菌根共生调控网络中的一个关键调控枢纽(图A-B)。EMSA和荧光素酶报告实验证实,OsPHR12可以直接结合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3启动子序列(图C-F),并且这种结合依赖于启动子中的P1BS元件(图G)。酵母三杂交系统原理酵母双杂交文库构建。湖南运用酵母文库报价
初筛+复筛提高目标阳性克隆质粒精确度。一对一筛库验证服务,客户无需再次验证。黑龙江运用酵母文库
酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。黑龙江运用酵母文库
上海欧易生物医学科技有限公司专注技术创新和产品研发,发展规模团队不断壮大。公司目前拥有较多的高技术人才,以不断增强企业重点竞争力,加快企业技术创新,实现稳健生产经营。公司以诚信为本,业务领域涵盖科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询,我们本着对客户负责,对员工负责,更是对公司发展负责的态度,争取做到让每位客户满意。公司力求给客户提供全数良好服务,我们相信诚实正直、开拓进取地为公司发展做正确的事情,将为公司和个人带来共同的利益和进步。经过几年的发展,已成为科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询行业出名企业。