您的珍贵样本,还可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统,BD RhapsodyTM单细胞捕获系统采用微孔技术,对细胞的捕获没有偏好性,实现高达80%的微孔板捕获率,由于单个微孔板中容纳了22万+个微孔,而现阶段单细胞测序实验技术通常要求单个样本捕获3000-5000,至高达10000个细胞,即可满足科研探索需求,因此这种“泊松分布”的原理类似于上样细胞的无限稀释过程,但22万+微孔的存在,也对大体量细胞数目的科学研究有很好的包容性,细胞通量分为可扩展至100-40000个细胞的捕获(单个微孔板),满足您的多重需求。烈冰斥巨资引进Novaseq6000,开启更大通量测序新纪元。上海single cell 单细胞平台
单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,首先针对下机数据的质控环节:单细胞测序产生数亿的结果序列,不可避免的会出现低质量的测序结果,存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征,即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性,为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。南京BD Rhapsody单细胞测序服务单细胞测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系,一度成为高通量测序技术的“天花板”。
烈冰与国内高校、研究所、医院和药企单位开展深度合作,服务于600+临床与研究机构,1000+客户和5000+重要科研项目,助力并联合发表300+篇CNS等国际学术期刊(不完全统计),在单细胞领域,烈冰助力用户发表单细胞文献30+篇,总IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物领域国际主流学术期刊,已发表文章研究领域涵盖包括COVID-19研究、疾病发生转移机制,免疫研究、脑神经、白血病、胚胎发育、糖尿病、退行性疾病和植物领域研究等。
据不完全统计,截至2022年6月,烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇,从平台应用比例来看,应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右,研究类型涵盖疾病发展,靶点探索,免疫研究,神经发育,干细胞分化,植物发育,退行病变,糖尿病,COVID-19等等研究;从发表期刊水平来看,烈冰生物联合发表的单细胞文章,CNS一区期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),风湿类领域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高达68.5%,烈冰专属单细胞测序服务团队,将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。搭配BD FACSMelody流式分选仪,全线搭建BD Rahpsody单细胞测序平台。
针对单细胞测序的细胞上样数,为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好?一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时,如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000,上样细胞悬液体积势必增加,在细胞悬液质量不是很理想(细胞活性<90%、碎片率>5%、结团率均>5%)的情况下,引入的背景信号会增加,分析结果不理想的直接体现包括:cell、non-cell无法有效区分和Fraction reads in cells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时,会使得数据出现假阳性和假阴性结果!当目标细胞捕获数很大时,多细胞率会增加,数据分析时,此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍(N是一个GEM包裹的细胞数),导致所有细胞的统计数据(单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数)虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤,但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除!高通量测序技术是对传统测序一次突破性的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定。广州BD Rhapsody单细胞测序服务公司
烈冰生物作为BD 中国联合成立单细胞测序实验室,为推动单细胞测序技术发展贡献中国力量。上海single cell 单细胞平台
关于单细胞测序实验样本制备,这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致,也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤,以确保您的样本有适当浓度的活细胞,并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要,您还可以使用抗体对样本进行染色,标记细胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤,具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小,以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何,所有样本类型都遵循同一个基本原则,那就是生成高质量的单细胞悬液。上海single cell 单细胞平台
上海烈冰生物医药科技有限公司拥有生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】等多项业务,主营业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。公司目前拥有较多的高技术人才,以不断增强企业重点竞争力,加快企业技术创新,实现稳健生产经营。公司业务范围主要包括:单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨,深受客户好评。一直以来公司坚持以客户为中心、单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序市场为导向,重信誉,保质量,想客户之所想,急用户之所急,全力以赴满足客户的一切需要。