GC-MS非靶向代谢组,标题:银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊:EnvironmentalScience&Technology影响因子:9.028发表时间:2020年2月合作单位:南京大学环境学院运用生物技术:16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)。银纳米颗粒(AgNPs)是使用*****的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征,但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息,鉴于它们的已知功能,人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法,研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。代谢组学 生物标志物挖掘**-欧易生物。上海代谢组学实验步骤
LC-MS和GC-MS两大平台是现今代谢组学研究**常用的两大技术平台,各自有其特点和优势,在物质检测的范围和种类上,都有一定的偏向性。往往一种方法、一个技术平台很难获取样品当中***的代谢物信息,为了解决这个问题,LC-MS+GC-MS这种组合式双平台解决方案,可以**提升代谢组学检测的覆盖度,获取更加***的代谢物及其丰度信息,鹿明生物运用此研究策略,已协助更多客户更好的达成了科研目标。鹿明生物、欧易生物双平台代谢组学可***研究代谢物的信息,为您的科学研究助力。上海功能代谢组学代谢组学方案改变科学的组学研究方案,即刻咨询!。
LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目:粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量,但不能区分疾病的严重程度期刊:HepatologyIF=17.425研究思路:*样本类型:人粪便*检测平台:LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学,考察微生物组变化和疾病严重程度的关系,推断微生物生态学变化的功能相关性,本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者(MAH和SAH)的粪便微生物组与健康(HC)和重度饮酒对照组(HDC)进行比较,通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类,使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸(SCFA)含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比,均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中,粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少,可以推断出,酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化,与酒精性肝炎的严重程度无关。
代谢组学经典研究:本篇小鹿将为各位看官推荐4篇使用代谢组学的经典研究,***篇文章运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学探究番茄果实成熟过程中的代谢变化。第二篇文章运用16S rRNA测序+代谢组学技术研究不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。第三篇文章运用GC-MS顶空代谢组学探究新等位基因系和野生型的成熟种子中发现了几种不同的挥发性化合物。第四篇文章运用GC-MS非靶向代谢组学技术对对全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黄瓜组织代谢途径变化进行了研究。代谢组学组学领域新方法和思路。
土壤代谢物可以间接反映微生物代谢过程的变化,使用基于GC-MS的非靶向代谢组学,在土壤样品***鉴定272种代谢物并对其进行非靶向代谢组学定量,定量结果表明AgNPs暴露***改变了土壤代谢物的分布。通过参数VIP>1.5,在土壤中鉴定出20种具有重要变化的代谢物(图3I),除少数几个代谢物上调,大多数代谢物减少,表明AgNPs暴露通常会对土壤微生物的代谢产生负面影响。土壤代谢组学可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上应对AgNPs并作出反应,包括毒性机制和***策略。代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。上海代谢组学 胆汁酸
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LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4.912发表时间:2021年11月2日合作单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室运用生物技术:LC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)上海代谢组学实验步骤
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