企业商机
单细胞基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研医学服务,高通量测序,科研服务,临床检测服务
单细胞企业商机

烈冰生物BD Rhapsody平台,采用精简的工作流程助力您的实验成功: 1.制备单细胞悬液:可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶联抗体( Ab-Oligos)将细胞染色 2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换 3.单细胞捕获工作流程: (1)细胞上样:上样 575微升细胞悬液;系统未采用微流体通道设计,无需担心通道堵寨;通过重力轻轻沉淀细胞,可捕获脆弱细胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000个分区,可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞 (2)细胞上样扫描:估算捕获的活细胞数量和细胞多态率 (3)磁珠上样:微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描:估算包含活细胞和磁珠的微孔数量;测定细胞存留率,评估是否发生细胞损失 (5)细胞裂解:使用裂解缓冲液,确保细胞完全裂解 (6)磁珠回收:轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况搭建多种测序数据的生物信息分析平台,5000+项目检验,真实可信赖。湖南BD VDJ单细胞测序公司

烈冰生物搭建近10台BD Rhapsody平台,目前为全国范围内的高校、医院和研究所等单位的科研学者提供服务,BD Rhapsody平台采用U型微孔板,1个板即对应1个样本(不混样的情况下),每个通道一般捕获细胞数在1000-10000个之间,而上限可捕获40000细胞时也能获得较低的双细胞率,此外,单个细胞捕获效率高达80%,可准确鉴别稀有细胞类型,有利于稀有样本或小细胞量类型样本研究;细胞可适性高,对细胞大小(直径超过40um细胞需要制备成细胞核)及类型无限制。细胞捕获周期较短,能够实现自动分离,且实验端捕获细胞过程全程可视化进行,保障每一例珍贵样本实验的成功进行,1天内可完成从细胞悬液到cDNA文库构建的所有的测序准备工作。广州single cell 单细胞测序服务烈冰BD Rahpsody单细胞测序平台,助力您的深入科学探究。

针对单细胞测序的细胞数量判断环节:主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准:由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中,并且测序中也会存在一些死细胞,导致数据存在background值。因此,我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例,细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点,当存在多个斜率拐点的时候,结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候,选择UMI=500作为细胞的判断的标准;否则,选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。

对于稀有样本,或细胞量比较少的稀有组织,样本中每一粒细胞都很珍贵,BD Rhapsody单细胞捕获平台对该种类型的样本能实现友好包容,如果在实际实验中,我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同,容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。也会和您探讨是否考虑去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物的操作,以获得高质量数据是至关重要的。这是因为,死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-free RNA会导致检测的背景噪声,并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时,对细胞悬液中细胞活性检测后,需要进行一般死细胞去除的工作(一般悬液活性小于70%时考虑此操作),以保证较高的上机捕获细胞的质量。搭配BD FACSMelody流式分选仪,全线搭建BD Rahpsody单细胞测序平台。

据不完全统计,截至2022年6月,烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇,从平台应用比例来看,应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右,研究类型涵盖疾病发展,靶点探索,免疫研究,神经发育,干细胞分化,植物发育,退行病变,糖尿病,COVID-19等等研究;从发表期刊水平来看,烈冰生物联合发表的单细胞文章,CNS一区期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),风湿类领域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高达68.5%,烈冰专属单细胞测序服务团队,将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。深度的单细胞测序数据解读助力医疗健康大时代。南京BD单细胞服务机构

十二年测序经验,累计服务与5000余项重要科研项目。湖南BD VDJ单细胞测序公司

基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BD Rhapsody单细胞平台以来,能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。湖南BD VDJ单细胞测序公司

上海烈冰生物医药科技有限公司拥有生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】等多项业务,主营业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。一批专业的技术团队,是实现企业战略目标的基础,是企业持续发展的动力。诚实、守信是对企业的经营要求,也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。公司力求给客户提供全数良好服务,我们相信诚实正直、开拓进取地为公司发展做正确的事情,将为公司和个人带来共同的利益和进步。经过几年的发展,已成为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序行业出名企业。

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