文章中酵母双杂交文库由欧易生物制备。2021年5月，北京林业大学钮世辉副教授为通讯作者，在PlantPhysiology杂志（IF:6.902）在线发表了题为“MADS-boxtranscriptionfactorsMADS11andDAL1interacttomediatethevegetative-to-reproductivetransitioninpine”的研究论文，深入探讨了油松中营养生长-生殖生长时相转变调控的分子机制。北京林业大学马晶晶博士为***作者，文章中酵母双杂交文库由欧易生物制备。本研究通过 7 个树龄的油松样品转录组测序，鉴定到一个与年龄信号***相关的基因模块，该模块包含 33 个转录因子，包括 SOC1-like、DAL1 等。酵母三杂交酵母文库数据库。重庆酵母文库是什么
通过传统的酵母双杂交系统，以PtDAL1为诱饵，筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆，10个一组，挑选到1个96孔板的PCR板孔中，获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板，进行PCR扩增，并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物，进行打断后构建二代测序文库，通过NGS测序，获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据，获得阳性克隆基因信息（去冗余后获得135个互作子，包含21个TFs，2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白，部分见表1）。挑选重要的候选基因进行一对一验证（图2）。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白（DIPs）的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析，并对DIPs进行GO注释（图3）。综合生信分析结果，构建针叶树老化途径的调控模型（图4）。湖南技术酵母文库酵母文库双杂交技术及应用。
酵母单杂交筛选：（4）在筛选到的转录因子中，***GL1促进HIV-2转录。***GL1在免疫细胞中***表达，并与HIV的其他转录***因子，即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用，本研究中显示HEK293T细胞中，***GL1过表达后，与LTR连接的萤火素酶表达上升近2倍，说明***GL1是一个转录***因子。值得一提的是，文章的背景介绍内容中，对应用其他技术（如RNAi、scRNA-seq、CRISPR等）对HIV转录调控方向的已有成果分析，发现这些方法为HIV-1的复制和潜伏期提供了见解，但并没有直接评估转录因子的结合和功能。文章中也对酵母单杂交技术与其他互作组技术（如Chip-seq、motif预测）进行了比较分析，发现eY1H技术对已识别因子的验证率为30-60%，同等或优于其他技术。
小欧从2018年即开始关注酵母杂交与高通量测序相结合的技术发展，如2017年CaoGang老师等发表的RLL-Y2H技术，实现了文库筛文库可能，该技术通过对酵母双杂常用载体的改造，并结合高通量测序，可直接获得AD-BD互作蛋白对。所用方法相当巧妙，感兴趣的同学请点击《当酵母双杂交遇到高通量测序》。钮老师团队之前的研究已经鉴定了DAL1作为一种保守的针叶树年龄生物标记基因，在油松从营养生长到生殖生长的时相转变过程中起重要作用。为了进一步理解年龄效应如何驱动针叶树的发育，阐明与DAL1相关的蛋白互作网络很关键。钮老师团队利用传统的Y2H筛选技术结合NGS测序技术，优化得到了Y2H-seq技术，与传统的筛选测序相比，大幅度节省了时间和实验成本。酵母文库质量检测酵母基因功能鉴定。
进行了酵母双杂交文库的筛选，结果显示钙依赖的种子特异性蛋白激酶SPK可以与OsNF-YB9相互作用，分段截取互作验证显示OsNF-YB9的N端是互作所必须的（图a-b），并通过双荧光分子互补实验、BiFC、体外GST-pulldown实验得以证实（图c-e）。亚细胞定位显示SPK主要在细胞质中表达，OsNF-YB9在细胞质和细胞核中都有表达，共表达SPK和OsNF-YB9***促进了OsNF-YB9的入核（图f），表明SPK和OsNF-YB9的相互作用可能促进了OsNF-YB9从细胞质向细胞核的运输。RT-PCR显示SPK在发育中的种子中高表达，在5DAF开始***，并在10-30DAF维持高表达水平（图a-b）。spk敲除突变体种子中垩白率的增加（图c-e），但粒形和粒重与野生型没有***差别。酵母文库构建的目的酵母的做法。重庆酵母文库是什么
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