GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题:氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊:FrontiersinMicrobiology影响因子:5.64作者单位:上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品:iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。上海流式细胞代谢组学
GC-MS非靶向代谢组学yan'j2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。
中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR 江苏非靶向代谢组学检测平台代谢组学 研究一站式服务平台。
微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关,并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺,调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层(mPFC)(关键的肠脑功能轴)的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。
GC-MS非靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析和氧化应激反应揭示了有机磷类阻燃剂磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基对大肠杆菌的毒性研究对象:大肠杆菌发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086作者单位:广东石油化工大学环境科学与工程学院涉及的欧易/鹿明生物服务产品:GC-MS非靶向代谢组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)以往有关呕吐***的研究多集中在免疫毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性等方面,而关于生长发育影响的研究较少。该研究是一篇通过大肠杆菌作为研究对象利用非靶向代谢组学来探究有机磷阻燃剂影响生物的发育和功能的高质量的、创新性的的研究文章,值得学习与借鉴。聚焦于代谢产物研究,采用高精尖的分析仪器,对细胞内的代谢物进行定性和定量分析。
粪便代谢组分析,中文标题:二烯丙基二硫化物(DADS)通过调节肠道微生物群和代谢物来保护小鼠肠道及改善白色念珠菌***研究对象:小鼠粪便发表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影响因子:5.293发表时间:2022年1月7日合作单位:复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科运用生物技术:粪便代谢组分析(由鹿明生物提供技术支持)、微生物16SrRNA测序。文章通过建立DSS 诱导的肠道白色念珠菌小鼠模型,模拟人类肠道******。一方面证实了白色念珠菌可以增强 DSS 结肠炎的严重程度,另一方面通过微生物组学和代谢组学等手段确认了 DADS ***可以改善肠道生态失调(改变肠道微生物群和代谢物)、肠道通透性和全身炎症反应。深入了解 DADS ***的效果可能会为肠道白色念珠菌***提供新的***策略。代谢组学,代谢组数据库,代谢组分析,利用非靶检测寻找差异代谢物。江苏代谢组学 杂志
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LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为环境污染物毒理学研究提供了新思路和方法。上海流式细胞代谢组学
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