江苏代谢组学通路富集分析

GC-MS非靶向代谢组研究，随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学赵丽娟课题组在Environmental Science & Technology杂志发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合，提供了对AgNPs生态影响的全新视角，***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。非靶向代谢组学，靶向代谢组学研究经验。江苏代谢组学通路富集分析

GC-MS代谢组学结果：通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物，其中，49种与数据库中可用的化合物相匹配，包括重要的发酵代谢物，如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量，表面（15 厘米）SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化，随着温度的升高，通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度（图 3）。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外，在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势（图 3）。此外，与植物应激反应相关的化合物（油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸）随温度升高而增加（SI 附录，图 S5）。江苏质代谢组学中科代谢组学专区 系统生物学驱动的功能代谢组学方法,具有高灵敏、高分辨和高通量。

LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目：粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量，但不能区分疾病的严重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*样本类型：人粪便*检测平台：LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学，考察微生物组变化和疾病严重程度的关系，推断微生物生态学变化的功能相关性，本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者（MAH和SAH）的粪便微生物组与健康（HC）和重度饮酒对照组（HDC）进行比较，通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类，使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸（SCFA）含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比，均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中，粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少，可以推断出，酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化，与酒精性肝炎的严重程度无关。

代谢组学研究，2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通过蛋白质组学和代谢组学研究方法，发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征，探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷，AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴，为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。以代谢组学为研究对象，探究细胞、组织或其变化规律的科学。

微生物组和代谢组学结果表明，高比例的直链淀粉/支链淀粉比例能够调节消化和粘膜相关的盲肠微生物群落和代谢特征。三种比例中，喂养含有50%高直链淀粉的饮食具有更好的结果，因为其共生细菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸盐的增加以及促炎细胞因子的减少。代谢组学结果显示盲肠组织的代谢特征发生了改变，包括脂质肉碱和α-生育酚等代谢物的上调和下调。这些发现为直链淀粉/支链淀粉的比例是如何通过调节微生物发酵，导致共生微生物群和代谢物的增殖，从而改善断奶山羊的盲肠环境提供了新的见解。本篇文章，检测了喂食不同直链淀粉/支链淀粉比例的山羊的盲肠中SCFAs和炎症因子的变化，并使用16s RNA测序检测了不同组山羊的盲肠粘膜和消化物中微生物的变化，找到了变化的优势菌群以及菌群和SCFAs的相关性。再使用LC-MS/MS非靶代谢组学研究了不同组山羊盲肠组织的代谢物变化。通过多组学结合的方式，揭示了不同比例的直链淀粉/支链淀粉对山羊盲肠环境的影响。欧易生物助力靶向/非靶向代谢组学研究。江苏非靶向代谢组学公司

氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢。江苏代谢组学通路富集分析

LC-MS靶向代谢组学研究本篇文章通过LC-MS靶向代谢组学和16S rRNA基因序列分析，探究谷物在加工传统饮料ogi过程中******的减少和细菌群落的动态变化。同时，从粮食安全方面考虑，谷物的污染水平低、较安全，又优于玉米，可以代替受******污染的玉米品种。欧易/鹿明生物推出的16s+代谢组学的多层组学研究思路继本篇文章前已先后助力了浙江工业大学、中国农科院、青岛农业大学等在微生物一区顶刊Microbiome、医学一区顶刊GUT发表文章。项目文章PBP | 浙江工业大学傅正伟运用GC-MS非靶向代谢组学和16S探究水稻根际微生物群落影响项目文章 | 恭喜中国农科院及青岛农业大学团队继GUT后又喜发微生物顶刊Microbiome。江苏代谢组学通路富集分析

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